Se forma un Comité Provisional con sede en San Sebastián y presidido por el Señor Gabriel María de Laffite.

El 24 de julio de 1920 en San Sebastián es aprobado provisionalmente el Reglamento redactado por la Federación Atlética Guipuzcoana y se designa el primer Comité Directivo, que preside Laffite.

Una vez constituida la Federación se afilia inmediatamente a la Internacional para poder participar en los Juegos Olímpicos de Amberes 1920.

En 2019 se abre juicio por abusos sexuales por parte del entrenador Miguel Ángel Millán, siendo la Federación convocada como responsable civil subsidiaria.

No obstante, con anterioridad Francisco Aritmendi se había impuesto en el Cross de las Naciones disputado en Dublín en 1964 y Carmen Valero se había proclamado doble campeona del mundo de campo a través en los años 70.