En la planta del edificio introduce algunos elementos que no eran de uso común en la arquitectura centroamericana; diferencia muy bien el área puramente oficial, sala del Tribunal, Contaduría, Tesorería, sala de azogues, pieza de quintar la plata; a este sector se entraba por un gran zaguán que llamaban los hombres a caballo y que estaban en la calle que el Río Chiquito sube a la Plaza Mayor.

En 1774 un terremoto logró dañar considerablemente la estructura, sin embargo fue reparada a los pocos meses aunque haya dejado más débil la casona.

En 1809 otro terremoto logró destruirla casi por completo a excepción de su fachada frontal y muro lateral y se decide no repararla por el peligro que representaba, esto pasearía también con la iglesia de nuestro señor de los Reyes, quien a diferencia del Caxa Real no logró salvarse.

Tras la independencia y la época republicana pasó por unos cuantos dueños, sin embargo nunca hubo un intento por ninguno de rehabilitarla o quitar las estructuras restantes, tras el inicio del siglo XX la casona quedó en absoluto abandono aunque todavía era visitada por turistas debido a su importancia histórica, sin embargo no sería reconstruida hasta décadas más tarde.

Dicha caja real ha sido concebida originalmente como un casa que sustituyera en el siglo XVIII a un edificio predecesor del cual todavía se desconoce su ubicación original.