El emperador Roberto fue expulsado de Constantinopla por sus súbditos en 1228.

Su hermano y sucesor Balduino II de Constantinopla perdió la corona cuando Constantinopla fue tomada por los griegos (1261), y murió en el exilio en Italia en 1273.

Al extinguirse los miembros de la rama mayor, la familia Courtenay cayó en el olvido.

Se habían convertido en señores provinciales menores, ya que la rama mayor había vendido la mayoría de las posesiones de la familia en su intento de preservar el Imperio Latino en Oriente.

Su sobrino Pedro III de Courtenay-Champignelles llegó a ser chambelán y asesor del rey Carlos VI.