El Campeonato de Primera C 1988-89 fue la quincuagésima quinta edición del certamen y la tercera de esta división como cuarta categoría del fútbol argentino.

El campeón fue Argentino de Quilmes, que de esta manera obtuvo el primer ascenso, mientras que el segundo fue para Ituzaingó, ganador del Torneo reducido.

Se disputó un torneo de 38 fechas por el sistema de todos contra todos ida y vuelta, quedando un equipo libre por fecha.

El equipo que más puntos obtuvo se consagró campeón y ascendió directamente.

Los equipos ubicados entre el segundo y el noveno puesto de la tabla de posiciones final clasificaron al Torneo reducido, cuyo ganador obtuvo el segundo ascenso.