El Campeonato de Primera D 1989-90 fue la cuadragésima edición del torneo.

El campeón fue Liniers, que obtuvo el ascenso a la Primera C. Asimismo, el ganador del Torneo reducido fue Argentino de Merlo, que consiguió el segundo ascenso.

El campeón ascendió directamente a la Primera C. Los equipos ubicados del segundo al noveno puesto participaron del Torneo reducido, cuyo ganador obtuvo el segundo ascenso.

Al final de la temporada, los dos equipos con peor promedio fueron suspendidos en su afiliación por un año.

Al haber finalizado igualados en puntos, Acassuso y Justo José de Urquiza debieron jugar un desempate en cancha neutral para definir qué equipo se quedaba con el noveno puesto, último cupo para el Torneo reducido.