El Campeonato de Primera D 1988-89 fue la trigésima novena edición del torneo, que se constituyó en el tercer certamen de la división como quinta categoría del fútbol argentino.

El campeón fue Midland, que terminó en primer lugar con 66 puntos.

De esta manera, se consagró campeón y obtuvo el ascenso a la Primera C. Asimismo, el ganador del Torneo reducido fue Barracas Central, que de esta manera obtuvo el segundo ascenso.

El campeón ascendió directamente a la Primera C. Los equipos ubicados del segundo al noveno puesto participaron del Torneo reducido, cuyo ganador obtuvo el segundo ascenso.

Al final de la temporada, los dos equipos con peor promedio fueron suspendidos en su afiliación por un año.