[11]​ Ese mismo año se afilió a la Asociación Argentina de Football, compitiendo en Segunda División.

Producto de la escisión sufrida ese año en la Asociación, fue promovido a División Intermedia para 1920.

En los años posteriores continuó haciendo buenas campañas, sin lograr clasificarse a la final por el ascenso.

En 1930 realizó su última buena campaña, quedando segundo en su sección y afuera del cuadrangular por el ascenso.

Al perder la cancha se fusionaron con el Club Atlético Sportivo Liniers Sud.

En 1948 se lo renombró al actual Club Social y Deportivo Liniers.

El 24 de octubre de 2023, mientras el club disputaba el Torneo Reducido por el cuarto ascenso a la Primera B, la AFA resolvió la eliminación del tercer descenso de la Primera Nacional, que hubiese sido hacia la Primera B, debido a que hubiese sido para un equipo directamente afiliado.

La rivalidad y vecindad generaron hechos folclóricos dónde llegaron a cruzarse las cuentas oficiales de cada equipo.

Curiosamente, ese equipo había hecho de local en el estadio de Liniers algunas fechas antes y unos meses más tarde inauguraría su actual estadio que se encuentra en la misma localidad que el predio que los dirigentes comprarían en la década de 1980 en el cual inauguraría su estadio actual años más tarde.

A principios de la década del '70, luego de perder su cancha ubicada en Ciudadela Norte, también pierde su sede social, ubicada en el barrio porteño que dio nombre al club, sobre la calle Madero.

Sin embargo, primero recupera la sede social en el barrio de Liniers, esta vez sobre la calle José León Suárez, mientras que en 1983 compró ocho hectáreas en San Justo, La Matanza al Estado Nacional, donde construyó su actual sede y estadio.

Paradójicamente, dicha estación se encuentra geográficamente en una localidad diferente a la del estadio, Ciudad Evita.

En el club se iniciaron varios jugadores reconocidos como Blas Giunta, exjugador de Boca Jrs.