Actualmente participa en la Primera C, cuarta división del fútbol nacional para los equipos directamente afiliados a la AFA.

[1]​ La primera cancha era la que pertenecía al Club Atlético Unión, construida en 1923 y ubicada en Caseros, que luego de la fusión pasó a pertenecer a la nueva entidad.

Por ese motivo el Torneo Apertura de Primera D de 1986 sirvió para decidir quienes continuarían en la Cuarta División (Primera C) y quienes descenderían a la Quinta División.

Jota no pudo clasificar y "bajó" a la nueva Primera D. En la temporada 1987/88 ganó el Octogonal de la mano de Guillermo Abbas y ascendió a la Primera C, superando en ambas finales a Villa San Carlos: fue 2-1 en la ida y 3-1 en la vuelta jugada en el estadio Ciudad de Caseros.

El héroe de esa tarde fue Walter Eduardo Gómez, que marcó los 2 goles.

En Semifinales, derrota en San Miguel frente Central Córdoba y victoria heroica en Rosario por 2-0.

En la final esperaba Argentino de Quilmes, con quien habían caído 3-1 y 4-1 durante el torneo.

Sin embargo este encuentro se ha disputado pocas veces dada las diferentes categorías entre un club y otro.

Pero, sin dudas, en esta oportunidad, la fiesta estaba fuera del campo de juego, donde los caserinos festejaron volver a tener casa propia.