Según Joan Corominas derivaría del árabe uyura, con un significado de onagro, asno salvaje.

Su territorio está representado en las hojas MTN50 (escala 1:50 000) 768 y 793 del Mapa Topográfico Nacional.

[7]​[8]​ Según la clasificación climática de Köppen, Ayora se encuadra en la variante Csa,[7]​ es decir clima mediterráneo de veranos cálidos y secos, con la media del mes más cálido superior a 22 °C.

Así pues, la fosa central, que actúa de espina dorsal y separa los relieves constituidos por amplias muelas, plataformas tabulares y pequeñas fosas o corredores interiores, es un «valle de valles».

Por tanto, el paisaje de Ayora tiene como componentes base a este gran corredor, creado por la prolongación hacia el sur de la fosa central, y a los relieves tabulares orientales y occidentales.

Por aquellos años, el investigador francés Henri Breuil dio a conocer las pinturas del Barranco Hondo —hoy mencionadas como abrigo de Pedro Mas – y la Cueva del Rey Moro en el Castellar de Meca.

En él se han encontrado partes de cerámica y monedas, así como diferentes objetos.

[13]​ Se ha sugerido que Axenia podría ser Axinio, la localidad soriana de Uxama Argaela.

A Ayora llegaron pobladores musulmanes, que coexistieron pacíficamente con los cristianos, conservando estos últimos su religión y sus costumbres.

Esta coexistencia, garantizada por varios privilegios, se mantuvo hasta 1609 con la expulsión de los moriscos.

Los sucesivos señores del Valle concedieron varios privilegios, dada su posición estratégica y su carácter fronterizo, destacando el Privilegio rodado de Alfonso X de Castilla (documento más antiguo conservado en la Villa) que recoge una serie de concesiones o franquicias que el rey otorga a Ayora.

[15]​ Aunque Ayora pertenece definitivamente al Reino de Valencia desde 1305, debido a su situación fronteriza se vio envuelta en las guerras entre Castilla y Aragón a lo largo del siglo XIV, sobre todo en el conflicto dinástico que enfrentó a Pedro I de Castilla y Pedro IV de Aragón siendo invadida y asediada en repetidas ocasiones.

Esta expulsión tuvo graves consecuencias ya que agravó el problema de la despoblación con la consiguiente ruina de la agricultura y demás actividades económicas, situación que se prolongará durante los siglos XVII y XVIII ya que los vacíos provocados por el decreto no fueron cubiertos por gentes de Valencia, que no disponía de suficientes recursos demográficos ni, al parecer, había tampoco buena disposición popular a ocupar tierras tan duras y apartadas.

Esta lamentable situación se agravó por los problemas de sequías, hambres y epidemias.

En julio de 1808 el pueblo llano se amotinó y asesinó al Alcalde Mayor.

La Guerra Civil se vivió de forma trágica por las continuas represalias y saqueos.

[21]​ Para el transporte de viajeros, las compañías Monbus y Chambitos ofrecen servicios por carretera a diferentes destinos como por ejemplo Valencia, Albacete, Almansa o Játiva.

En esta misma localidad se encuentran las pinturas rupestres destacando la apicultura más antigua del mundo.

[31]​ Además, el municipio cuenta con una asamblea de Cruz Roja Española[32]​ y dos farmacias.

[35]​ El municipio cuenta con Policía Local[36]​ y con un puesto de la Guardia Civil.

Edificado posiblemente a mediados del siglo XIII, tras la reconquista cristiana, sobre una antigua construcción árabe.

Entre sus restos cabe destacar la torre del homenaje, de planta cuadrada, la «puerta falsa», mandada construir por la marquesa del Zenete en el siglo XVI, sobre la que está su escudo de armas, así como lienzos, murallas, cubos, fosos, cisternas.

Se sabe que existía en época musulmana y la parroquia debió fundarse tras la reconquista, sobre una antigua mezquita, hacia el siglo XV.

Su airosa estructura metálica es modernista y se sitúa en el centro del pueblo, al inicio de la Plaza Mayor.

Cavanilles, geógrafo y botánico valenciano la describió como 'superior a cuantas hay en el Reino, sin exceptuar las de la capital'.

Además se conservan restos de las murallas ciclópeas, torres defensivas, casas semi-excavadas en la roca, escaleras, pesebres y abrevaderos.

A la importancia cultural, arquitectónica y urbanística se une la espectacularidad del paisaje circundante; al estar situada a 1058 m de altura sobre el nivel del mar permite contemplar una panorámica de gran belleza.

En Ayora se celebran otras fiestas al igual que en el resto de la comarca o del país, destacando los carnavales por su particularidad y participación popular, y la Semana Santa por la vistosidad de sus procesiones.

Por Ayora han circulado en años pasados grupos como Mecano, Radio Futura, La Dama se Esconde, El Norte, Presuntos Implicados, Loquillo, Luz, Joaquín Sabina, Héroes del Silencio, Seguridad Social, Miguel Bosé, etc. Como en toda fiesta que se precie, en Ayora pone el punto final el disparo de un castillo de fuegos artificiales.

Existen varias rutas para bicicleta de montaña y una marcha cicloturista que se suele celebrar en mayo.