Antonio tuvo tres hermanas:[2] Quedó huérfano de padre en 1563, pasando a ser Adelantado Mayor de Castilla.
Finalmente se consiguió convencerle y volvió a Valladolid.
Su noviciado en Medina del Campo se inició teniendo como maestro a Baltasar Álvarez.
Durante su vida religiosa llevó a cabo tareas de todo tipo, incluyendo aquellas consideradas más humillantes en la época como cargar con un saco o ir a comprar carne al rastro.
Fue muy cercano a su compañero jesuita Luis de la Puente.