Ha trabajado con artistas como Depeche Mode, Erasure, Elastica, Gary Numan, The Jesus and Mary Chain, Curve y My Bloody Valentine, Lostprophets, Shihad, Ivyrise, Placebo y Suede, así como con artistas estadounidenses como The Killers, Nine Inch Nails, A Perfect Circle, The Smashing Pumpkins, Them Crooked Vultures, Death Cab for Cutie, Yeah Yeah Yeahs, How to Destroy Angels, Interpol y Against Me!.
La producción del álbum fue elogiada por su combinación de guitarra ruidosa que se escucha un tono pulido y la discográfica de la banda, Creation Records, pronto tuvo a Moulder produciendo discos para My Bloody Valentine y Swervedriver.
En 1992, mezcló para The Smashing Pumpkins "Siamese Dream", y para la banda Ride el álbum Going Blank Again.
Alan Moulder ha trabajado con Lostprophets en una canción después del lanzamiento de su disco debut The Fake Sound of Progress.
También mezcló el álbum de Saul Williams, The Inevitable Rise and Liberation of NiggyTardust!.
Para el verano de 2012, Jimmy Page, al no estar conforme con la mezcla estéreo del álbum en vivo de Led Zeppelin, "Celebration Day", llamó a Alan Moulder para que remezclara el audio en estéreo y 5.1.