Ingresó en 2015 a Tandanor (Buenos Aires) para mantenimiento mayor; fue paralizado y la nave se halla en las instalaciones de ese astillero con el trabajo inconcuso.
También formó parte del ejercicio aeronaval combinado Gringo-Gaucho, en donde la nave protagonista fue el USS George Washington (CVN-73).
La participación en ejercicios conjuntos y combinados fue constante, realizando despliegues en diferentes puntos del Mar Argentino.
Mientras ingresaba a la zona portuaria, el buque sufrió una varadura, logrando ser removido por remolcadores tras dos horas de trabajo.
[cita requerida] El ministro de Defensa Oscar Aguad interrumpió los trabajos al desaparecer el ARA San Juan en noviembre de 2017, para determinar si ese accidente fue causado por una falla que podría repetirse en el ARA Santa Cruz.
Para recuperar la Fuerza de Submarinos, el gobierno argentino decidió reparar el Santa Cruz.