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Ontología (ciencia de la información)

En ciencia de la información , una ontología abarca una representación, denominación formal y definiciones de las categorías, propiedades y relaciones entre los conceptos, datos o entidades que pertenecen a uno, muchos o todos los dominios del discurso . Más simplemente, una ontología es una forma de mostrar las propiedades de un área temática y cómo se relacionan, definiendo un conjunto de términos y expresiones relacionales que representan las entidades en esa área temática. El campo que estudia las ontologías así concebidas a veces se denomina ontología aplicada . [1]

Cada disciplina o campo académico, al crear su terminología, sienta las bases para una ontología. Cada uno utiliza supuestos ontológicos para enmarcar teorías, investigaciones y aplicaciones explícitas. Las ontologías mejoradas pueden mejorar la resolución de problemas dentro de ese dominio, la interoperabilidad de los sistemas de datos y la capacidad de descubrimiento de los datos. Traducir artículos de investigación en todos los campos es un problema que se facilita cuando expertos de diferentes países mantienen un vocabulario controlado de jerga entre cada uno de sus idiomas. [2] Por ejemplo, la definición y ontología de la economía es una preocupación principal en la economía marxista , [3] pero también en otros subcampos de la economía . [4] Un ejemplo de economía que se basa en la ciencia de la información ocurre en los casos en que una simulación o modelo pretende permitir decisiones económicas, como determinar qué activos de capital están en riesgo y en qué medida (ver gestión de riesgos ).

Lo que tienen en común las ontologías tanto en la ciencia de la información como en la filosofía es el intento de representar entidades, incluidos objetos y eventos, con todas sus propiedades y relaciones interdependientes, de acuerdo con un sistema de categorías. En ambos campos, hay un trabajo considerable sobre problemas de ingeniería ontológica (por ejemplo, Quine y Kripke en filosofía, Sowa y Guarino en ciencias de la información), [5] y debates sobre hasta qué punto es posible la ontología normativa (por ejemplo, fundacionalismo y coherentismo en filosofía, BFO y Cyc en inteligencia artificial).

Algunos consideran que la ontología aplicada es una sucesora de trabajos anteriores en filosofía. Sin embargo, muchos esfuerzos actuales están más preocupados por establecer vocabularios controlados de dominios estrechos que por primeros principios filosóficos , o por cuestiones como el modo de existencia de las esencias fijas o si los objetos duraderos (por ejemplo, el perdurantismo y el endurantismo ) pueden ser ontológicamente más primarios que los procesos. . La inteligencia artificial ha retenido una atención considerable con respecto a la ontología aplicada en subcampos como el procesamiento del lenguaje natural dentro de la traducción automática y la representación del conocimiento , pero los editores de ontología se utilizan a menudo en una variedad de campos, incluida la informática biomédica, [6] la industria. [7] Tales esfuerzos a menudo utilizan herramientas de edición de ontologías como Protégé. [8]

Ontología en Filosofía

La ontología es una rama de la filosofía e intersecta áreas como la metafísica, la epistemología y la filosofía del lenguaje, ya que considera cómo el conocimiento, el lenguaje y la percepción se relacionan con la naturaleza de la realidad. La metafísica se ocupa de preguntas como "¿qué existe?" y "¿cuál es la naturaleza de la realidad?". La metafísica, una de las cinco ramas tradicionales de la filosofía, se ocupa de explorar la existencia a través de propiedades, entidades y relaciones como las que existen entre particulares y universales , propiedades intrínsecas y extrínsecas , o esencia y existencia . La metafísica ha sido un tema de discusión constante desde la historia registrada.

Etimología

La palabra compuesta ontología combina onto- , del griego ὄν, on ( gen. ὄντος, ontos ), es decir "ser; aquello que es", que es el participio presente del verbo εἰμί, eimí , es decir "ser, soy". ", y -λογία, -logia , es decir, "discurso lógico", véanse los compuestos clásicos para este tipo de formación de palabras. [9] [10]

Si bien la etimología es griega, el registro existente más antiguo de la palabra en sí, la forma neolatina ontologia , apareció en 1606 en la obra Ogdoas Scholastica de Jacob Lorhard ( Lorhardus ) y en 1613 en el Lexicon philosophicum de Rudolf Göckel ( Goclenius ). [11]

La primera aparición en inglés de ontología según lo registrado por el OED ( Oxford English Dictionary , edición en línea, 2008) se produjo en Archeologia Philosophica Nova o New Principles of Philosophy de Gideon Harvey .

Ontología formal

Desde mediados de la década de 1970, los investigadores en el campo de la inteligencia artificial (IA) han reconocido que la ingeniería del conocimiento es la clave para construir sistemas de IA grandes y potentes [ cita requerida ] . Los investigadores de IA argumentaron que podían crear nuevas ontologías como modelos computacionales que permitieran ciertos tipos de razonamiento automatizado , lo cual sólo tuvo un éxito marginal . En la década de 1980, la comunidad de IA comenzó a utilizar el término ontología para referirse tanto a una teoría de un mundo modelado como a un componente de sistemas basados ​​en el conocimiento . En particular, David Powers introdujo la palabra ontología en la IA para referirse al mundo real o a la conexión a tierra robótica, [12] [13] [14] publicando en 1990 reseñas de literatura que enfatizan la ontología basada en la tierra en asociación con la convocatoria de artículos para un Simposio de Verano de AAAI. Aprendizaje del Lenguaje Natural y Ontología, con una versión ampliada publicada en el Boletín SIGART e incluida como prefacio de las actas. [15] Algunos investigadores, inspirándose en las ontologías filosóficas, vieron la ontología computacional como una especie de filosofía aplicada. [dieciséis]

En 1993, la página web y el artículo ampliamente citados "Hacia principios para el diseño de ontologías utilizadas para compartir conocimientos" de Tom Gruber [17] utilizaron ontología como un término técnico en informática estrechamente relacionado con la idea anterior de redes semánticas y taxonomías . Gruber introdujo el término como una especificación de una conceptualización :

Una ontología es una descripción (como una especificación formal de un programa) de los conceptos y relaciones que pueden existir formalmente para un agente o una comunidad de agentes. Esta definición es consistente con el uso de ontología como conjunto de definiciones de conceptos, pero más general. Y es un sentido diferente de la palabra que su uso en filosofía. [18]

Al intentar distanciar las ontologías de las taxonomías y esfuerzos similares en el modelado del conocimiento que se basan en clases y herencia , Gruber afirmó (1993):

Las ontologías a menudo se equiparan con jerarquías taxonómicas de clases, definiciones de clases y la relación de subsunción , pero las ontologías no necesitan limitarse a estas formas. Las ontologías tampoco se limitan a definiciones conservadoras  , es decir, definiciones en el sentido lógico tradicional que sólo introducen terminología y no añaden ningún conocimiento sobre el mundo. [19] Para especificar una conceptualización, es necesario enunciar axiomas que limiten las posibles interpretaciones de los términos definidos. [20]

Como refinamiento de la definición de Gruber, Feilmayr y Wöß (2016) afirmaron: "Una ontología es una especificación formal y explícita de una conceptualización compartida que se caracteriza por la alta expresividad semántica necesaria para una mayor complejidad". [21]

Componentes de ontología formal

Las ontologías contemporáneas comparten muchas similitudes estructurales, independientemente del lenguaje en el que se expresen. La mayoría de las ontologías describen individuos (instancias), clases (conceptos), atributos y relaciones.

Tipos

Ontología de dominio

Una ontología de dominio (u ontología de dominio específico) representa conceptos que pertenecen a un ámbito del mundo, como la biología o la política. Cada ontología de dominio normalmente modela definiciones de términos específicas de un dominio. Por ejemplo, la palabra tarjeta tiene muchos significados diferentes. Una ontología sobre el dominio del póquer modelaría el significado de " naipe " de la palabra, mientras que una ontología sobre el dominio del hardware informático modelaría los significados de " tarjeta perforada " y " tarjeta de video ".

Dado que las ontologías de dominio están escritas por diferentes personas, representan conceptos de maneras muy específicas y únicas y, a menudo, son incompatibles dentro del mismo proyecto. A medida que los sistemas que dependen de ontologías de dominio se expanden, a menudo necesitan fusionar ontologías de dominio ajustando manualmente cada entidad o utilizando una combinación de fusión de software y ajuste manual. Esto presenta un desafío para el diseñador de ontologías. Diferentes ontologías en el mismo dominio surgen debido a diferentes lenguajes, diferentes usos previstos de las ontologías y diferentes percepciones del dominio (basadas en antecedentes culturales, educación, ideología, etc.) [ cita necesaria ] .

En la actualidad, fusionar ontologías que no se desarrollan a partir de una ontología superior común es un proceso en gran medida manual y, por lo tanto, requiere mucho tiempo y es costoso. Las ontologías de dominio que utilizan la misma ontología superior para proporcionar un conjunto de elementos básicos con los que especificar los significados de las entidades de la ontología de dominio se pueden fusionar con menos esfuerzo. Hay estudios sobre técnicas generalizadas para fusionar ontologías, [22] pero esta área de investigación aún está en curso, y es un evento reciente ver el problema eludido al tener ontologías de múltiples dominios que utilizan la misma ontología superior como OBO Foundry .

ontología superior

Una ontología superior (u ontología fundamental) es un modelo de relaciones y objetos comúnmente compartidos que generalmente son aplicables en una amplia gama de ontologías de dominio. Por lo general, emplea un glosario central que abarca los términos y las descripciones de objetos asociados tal como se utilizan en varias ontologías de dominio relevantes.

Las ontologías superiores estandarizadas disponibles para su uso incluyen BFO , método BORO , Dublin Core , GFO , Cyc , SUMO , UMBEL y DOLCE . [23] [24] WordNet ha sido considerado una ontología superior por algunos y se ha utilizado como una herramienta lingüística para aprender ontologías de dominio. [25]

Ontología híbrida

La ontología Gellish es un ejemplo de una combinación de una ontología superior y de dominio.

Visualización

Katifori et al. presentan un estudio de los métodos de visualización de ontologías. [26] Dudás et al. publicaron un estudio actualizado sobre métodos y herramientas de visualización de ontologías. [27] Fu et al. evalúan los métodos de visualización de ontologías más establecidos, a saber, visualización de gráficos y árboles con sangría. [28] Un lenguaje visual para ontologías representadas en OWL está especificado por la Notación Visual para Ontologías OWL (VOWL) . [29]

Ingeniería

La ingeniería de ontologías (también llamada construcción de ontologías) es un conjunto de tareas relacionadas con el desarrollo de ontologías para un dominio particular. [30] Es un subcampo de la ingeniería del conocimiento que estudia el proceso de desarrollo de ontologías, el ciclo de vida de las ontologías, los métodos y metodologías para construir ontologías y las herramientas y lenguajes que las soportan. [31] [32]

La ingeniería ontológica tiene como objetivo hacer explícito el conocimiento contenido en las aplicaciones de software y los procedimientos organizativos para un dominio particular. La ingeniería ontológica ofrece una dirección para superar obstáculos semánticos, como los relacionados con las definiciones de términos comerciales y clases de software. Los desafíos conocidos de la ingeniería ontológica incluyen:

  1. Garantizar que la ontología esté actualizada con el conocimiento del dominio y el uso de términos.
  2. Proporcionar suficiente especificidad y cobertura conceptual para el dominio de interés, minimizando así el problema de integridad del contenido.
  3. Garantizar que la ontología pueda soportar sus casos de uso.

Editores

Los editores de ontologías son aplicaciones diseñadas para ayudar en la creación o manipulación de ontologías. Es común que los editores de ontologías utilicen uno o más lenguajes de ontologías .

Los aspectos de los editores de ontologías incluyen: posibilidades de navegación visual dentro del modelo de conocimiento , motores de inferencia y extracción de información ; soporte para módulos; la importación y exportación de lenguajes de representación de conocimientos extranjeros para la comparación de ontologías ; y el soporte de metaontologías como OWL-S , Dublin Core , etc. [33]

Aprendiendo

El aprendizaje de ontologías es la creación automática o semiautomática de ontologías, incluida la extracción de términos de un dominio a partir de texto en lenguaje natural. Como crear ontologías manualmente requiere mucho trabajo y mucho tiempo, existe una gran motivación para automatizar el proceso. Se ha explorado la extracción de información y la minería de textos para vincular automáticamente ontologías a documentos, por ejemplo en el contexto de los desafíos BioCreative. [34]

Investigación

Los supuestos epistemológicos, que en la investigación preguntan "¿Qué sabes? o "¿Cómo lo sabes?", crean la base que utilizan los investigadores cuando abordan un determinado tema o área para una posible investigación. Como la epistemología está directamente relacionada con el conocimiento y cómo llegamos acerca de aceptar ciertas verdades, las personas que realizan investigaciones académicas deben comprender qué les permite comenzar a construir teorías. Simplemente, los supuestos epistemológicos obligan a los investigadores a cuestionar cómo llegan al conocimiento que tienen. [ cita necesaria ]

Idiomas

Un lenguaje de ontología es un lenguaje formal utilizado para codificar una ontología. Existen varios lenguajes de este tipo para ontologías, tanto propietarios como basados ​​en estándares:

Ejemplos publicados

El proyecto comunitario Linking Open Data del W3C coordina los intentos de converger diferentes ontologías en una Web Semántica mundial .

Bibliotecas

El desarrollo de las ontologías ha llevado a la aparición de servicios que proporcionan listas o directorios de ontologías llamados bibliotecas de ontologías.

Las siguientes son bibliotecas de ontologías seleccionadas por humanos.

Los siguientes son directorios y motores de búsqueda.

Ejemplos de aplicaciones

En general, las ontologías se pueden utilizar de forma beneficiosa en varios campos.

Ver también

Conceptos filosóficos relacionados

Referencias

  1. ^ Ontología. Prensa de la Universidad McGill-Queen . 2002-11-26. pag. 4.ISBN​ 9780773582675. La ontología aplicada, como disciplina o dominio, es científica en el sentido de que aplica la definición de ser para determinar los compromisos ontológicos de otras disciplinas, en particular, aunque no exclusivamente, en las ciencias naturales, de manera muy similar a como las matemáticas aplicadas en la ingeniería se relacionan con las matemáticas puras. matemáticas.
  2. ^ G Budin (2005), "Gestión de la traducción basada en ontologías", en Helle V. Dam (ed.), Sistemas de conocimiento y traducción , Jan Engberg, Heidrun Gerzymisch-Arbogast, Walter de Gruyter, p. 113, ISBN 978-3-11-018297-2
  3. ^ Palermo, Giulio (10 de enero de 2007). "La ontología del poder económico en el capitalismo: la economía dominante y Marx". Revista de Economía de Cambridge . 31 (4): 539–561. doi :10.1093/cje/bel036 - vía Oxford Journals.
  4. ^ Zúñiga, Gloria L. (2 de febrero de 1999). "Una ontología de objetos económicos". Papel Mpra . División de Investigación del Banco de la Reserva Federal de St. Louis . Consultado el 16 de junio de 2013 .
  5. ^ Sowa, JF (1995). "Categorías ontológicas de primer nivel". Revista internacional de estudios humanos-computadores . 43 (5–6 (noviembre/diciembre)): 669–85. doi :10.1006/ijhc.1995.1068.
  6. ^ {Bioportal
  7. ^ Fundición de ontologías industriales
  8. ^ Musen, Mark (2015). "El Proyecto Protégé: una mirada atrás y una mirada hacia adelante". La IA importa . 1 (4): 4–12. doi :10.1145/2757001.2757003. PMC 4883684 . PMID  27239556. 
  9. ^ "ontología". Diccionario de etimología en línea .
  10. ^ εἰμί. Liddell, Henry George ; Scott, Robert ; Un léxico griego-inglés en el Proyecto Perseo
  11. ^ Smith, Barry (2022). "El nacimiento de la ontología". Revista de estructuras y sistemas de conocimiento . 3 : 57–66.
  12. ^ Poderes, David (1983). "Inteligencia robótica". Electrónica hoy internacional .
  13. ^ Poderes, David (1984). "Lenguaje natural de forma natural". Compactos de computadora . 2 (3–4): 100–109. doi :10.1016/0167-7136(84)90088-X.
  14. ^ Poderes, David; Turco, Chris (1989). Aprendizaje automático del lenguaje natural . Springer-Verlag. ISBN 978-1-4471-1697-4.
  15. ^ Poderes, David (1991). Prefacio: objetivos, problemas y direcciones en el aprendizaje automático del lenguaje natural y la ontología . Simposio de primavera de AAAI sobre aprendizaje automático de lenguaje natural y ontología. DFKI.
  16. ^ Gruber, T. (2008). "Ontología". En Liu, Ling ; Özsu, M. Tamer (eds.). Enciclopedia de sistemas de bases de datos . Springer-Verlag. ISBN 978-0-387-49616-0.
  17. ^ Gruber, T. (1993). "Hacia principios para el diseño de ontologías utilizadas para compartir conocimientos". Revista internacional de estudios humanos-computadores . 43 (5–6): 907–928. doi : 10.1006/ijhc.1995.1081 . S2CID  1652449.
  18. ^ Gruber, T. (2001). "¿Qué es una ontología?". Universidad Stanford . Archivado desde el original el 16 de julio de 2010 . Consultado el 9 de noviembre de 2009 .
  19. ^ Enderton, HB (12 de mayo de 1972). Una introducción matemática a la lógica (1 ed.). San Diego, CA: Prensa académica. pag. 295.ISBN 978-0-12-238450-9.2da edición; 5 de enero de 2001.
  20. ^ Gruber, Thomas R. (junio de 1993). "Un enfoque de traducción de especificaciones de ontologías portátiles" (PDF) . Adquisición de conocimientos . 5 (2): 199–220. CiteSeerX 10.1.1.101.7493 . doi :10.1006/knac.1993.1008. S2CID  15709015. 
  21. ^ Feilmayr, Cristina; Wöß, Wolfram (2016). "Un análisis de ontologías y sus factores de éxito para su aplicación a los negocios". Ingeniería de datos y conocimiento . 101 : 1–23. doi :10.1016/j.datak.2015.11.003.
  22. ^ "Proyecto: Reparación de ontologías dinámicas". Departamento de Informática de la Universidad de Edimburgo . Consultado el 2 de enero de 2012 .
  23. ^ ab "Laboratorio de Ontología Aplicada - DOLCE". Laboratorio de Ontología Aplicada (LOA) . Consultado el 10 de febrero de 2011 .
  24. ^ ab "Versión OWL de DOLCE + DnS". Laboratorio de Tecnología Semántica . Consultado el 21 de febrero de 2013 .
  25. ^ Navigli, Roberto; Velardi, Paola (2004). "Aprendizaje de ontologías de dominio a partir de almacenes de documentos y sitios web dedicados". Ligüística computacional . Prensa del MIT. 30 (2): 151–179. CiteSeerX 10.1.1.329.6965 . doi :10.1162/089120104323093276. S2CID  2453822. 
  26. ^ Katifori, A.; Halatsis, C.; Lepouras, G.; Vassilakis, C.; Giannopoulou, E. (2007). "Métodos de visualización de ontologías: una encuesta" (PDF) . Encuestas de Computación ACM . 39 (4): 10. CiteSeerX 10.1.1.330.3281 . doi :10.1145/1287620.1287621. S2CID  14205872. Archivado desde el original (PDF) el 4 de marzo de 2016. 
  27. ^ Dudas, M.; Lohmann, S.; Svátek, V.; Pávlov, D. (2018). "Métodos y herramientas de visualización de ontologías: un estudio del estado del arte". Revisión de ingeniería del conocimiento . 33 (e10). doi :10.1017/S0269888918000073. S2CID  52965103.
  28. ^ Fu, Bo; Noy, Natalya F.; Pisos, Margaret-Anne (2013). "¿Árbol o gráfico con sangría? Un estudio de usabilidad de técnicas de visualización de ontologías en el contexto de la evaluación del mapeo de clases". La Web Semántica - ISWC 2013: 12.ª Conferencia Internacional sobre la Web Semántica, Sydney, NSW, Australia, 21 al 25 de octubre de 2013, Actas, Parte I. Apuntes de conferencias sobre informática. vol. 8218. Berlín: Springer. págs. 117-134. doi : 10.1007/978-3-642-41335-3_8 . ISBN 978-3-642-41335-3.
  29. ^ Negro, Stefan; Lohmann, Steffen; Haag, Florian (7 de abril de 2014). "VOWL: Notación visual para ontologías OWL: Especificación de la versión 2.0". Web de datos visuales .
  30. ^ Bolsard, Línea; Ivezic, Nenad; Schlenoff, Craig (marzo de 2000). "Ingeniería ontológica para la colaboración distribuida en la fabricación" (PDF) . Actas de la Conferencia AIS2000 .
  31. ^ Gómez-Pérez, Ascunión; Fernández-López, Mariano; Corcho, Óscar (2004). Ingeniería Ontológica: Con Ejemplos de las Áreas de Gestión del Conocimiento, Comercio Electrónico y Web Semántica (1 ed.). Saltador. pag. 403.ISBN 978-1-85233-551-9.
  32. ^ De Nicola, Antonio; Missikoff, Michele; Navigli, Roberto (2009). "Un enfoque de ingeniería de software para la construcción de ontologías" (PDF) . Sistemas de información . Elsevier. 34 (2): 258–275. doi :10.1016/j.is.2008.07.002.
  33. ^ Alatrish, Emhimed (2013). "Una comparación de algunos editores de ontologías" (PDF) . Sistemas de Información Gerencial . 8 (2): 18–24.
  34. ^ Krallinger, M; Leitner, F; Vázquez, M; Salgado, D; Marcela, C; Tyers, M; Valencia, A; Chatr-Aryamontri, A (2012). "Cómo vincular ontologías e interacciones proteína-proteína con la literatura: enfoques de minería de textos y la experiencia Bio Creative". Base de datos . 2012 : bas017. doi : 10.1093/database/bas017. PMC 3309177 . PMID  22438567. 
  35. ^ "SADL". FuenteForge . Consultado el 10 de febrero de 2011 .
  36. ^ Jarrar, Mustafa (2021). "La ontología árabe: una Wordnet árabe con contenido ontológicamente limpio". Ontología Aplicada . 16 : 1–26. arXiv : 2205.09664 . doi :10.3233/AO-200241. S2CID  231886117.
  37. ^ "AURUM - Ontología de seguridad de la información" . Consultado el 29 de enero de 2016 .
  38. ^ "Ontología formal básica (BFO)". Instituto de Ontología Formal y Ciencias de la Información Médica (IFOMIS).
  39. ^ "BioPAX" . Consultado el 10 de febrero de 2011 .
  40. ^ Osterwalder, Alejandro; Pigneur, Yves (17 al 19 de junio de 2002). Una ontología de modelo de negocio electrónico para modelar el negocio electrónico (PDF) . 15ª Conferencia electrónica de Bled , Eslovenia . Archivado desde el original (PDF) el 19 de abril de 2011.
  41. ^ Hacia arriba, Antonio; Jones, Peter (2016). "Una ontología para modelos de negocio fuertemente sostenibles: definición de un marco empresarial compatible con las ciencias naturales y sociales". Organización y Medio Ambiente . 29 (1): 97-123. doi :10.1177/1086026615592933. S2CID  145089240.
  42. ^ "Acerca de CCO y GexKB". Biología de sistemas semánticos. Archivado desde el original el 30 de julio de 2012.
  43. ^ "CContología" . Consultado el 10 de febrero de 2011 .
  44. ^ "El modelo de referencia conceptual (CRM) de CIDOC" . Consultado el 10 de febrero de 2011 .
  45. ^ "COSMO". MICRA Inc. Consultado el 10 de febrero de 2011 .
  46. ^ Osborne, JD; Flatow, J; Holko, M; Lin, SM; Kibbe, WA; Zhu, LJ; Danila, MI; Feng, G; Chisholm, RL (2009). "Anotar el genoma humano con ontología de enfermedades". Genómica BMC . 10 (Suplemento 1): T6. doi : 10.1186/1471-2164-10-S1-S6 . PMC 2709267 . PMID  19594883. 
  47. ^ Damián, Rossana; Lombardo, Vincenzo; Pizzo, Antonio (2005). "Codificación formal de la ontología dramática" (PDF) . En Subsol, Gérard (ed.). Narración virtual. Uso de tecnologías de realidad virtual para contar historias . Apuntes de conferencias sobre informática. vol. 3805. Springer Berlín Heidelberg. págs. 95-104. doi :10.1007/11590361_11. hdl : 2318/148510 . ISBN 9783540322856. S2CID  29113893.
  48. ^ "Ontología empresarial de la industria financiera (FIBO)" . Consultado el 15 de marzo de 2017 .
  49. ^ "Ontologías fundacionales, centrales y lingüísticas" . Consultado el 10 de febrero de 2011 .
  50. ^ "Modelo fundamental de anatomía" . Consultado el 10 de febrero de 2011 .
  51. ^ "Extensión del coche" . Consultado el 15 de junio de 2017 .
  52. ^ "ORO" . Consultado el 10 de febrero de 2011 .
  53. ^ "Modelo superior generalizado" . Consultado el 10 de febrero de 2011 .
  54. ^ "El sitio web del Grupo IDEAS". Archivado desde el original el 16 de diciembre de 2018 . Consultado el 10 de febrero de 2011 .
  55. ^ "Base de enlaces". Archivado desde el original el 18 de septiembre de 2008 . Consultado el 10 de febrero de 2011 .
  56. ^ Guía de referencia de la consola de configuración: Landmark Pattern Language (LPL) Archivado el 4 de febrero de 2020 en Wayback Machine . Consultado el 4 de febrero de 2020.
  57. ^ "Bioportal". Centro Nacional de Ontología Biológica (NCBO). Archivado desde el original el 12 de junio de 2009 . Consultado el 24 de octubre de 2013 .
  58. ^ "Navegador de ontologías para la mayoría de las ontologías biológicas y biomédicas abiertas". Proyecto de código abierto de bioinformática de Berkeley (BBOP).
  59. ^ "Las ontologías biológicas y biomédicas abiertas". Proyecto de código abierto de bioinformática de Berkeley (BBOP).
  60. ^ "Ontología OMNIBUS". Archivado desde el original el 19 de julio de 2012 . Consultado el 10 de febrero de 2011 .
  61. ^ "ONSTR". Archivado desde el original el 16 de abril de 2014 . Consultado el 16 de abril de 2014 .
  62. ^ "Ontología vegetal" . Consultado el 10 de febrero de 2011 .
  63. ^ "PROFESIONAL". Archivado desde el original el 10 de marzo de 2011 . Consultado el 10 de febrero de 2011 .
  64. ^ "ProbOnto" . Consultado el 1 de julio de 2017 .
  65. ^ Golpear, MJ; Grenon, P; Wimalaratne, S (2016). "ProbOnto: ontología y base de conocimiento de distribuciones de probabilidad". Bioinformática . 32 (17): 2719–21. doi : 10.1093/bioinformática/btw170. PMC 5013898 . PMID  27153608. 
  66. ^ "Ontología de proteínas". Archivado desde el original el 10 de marzo de 2011 . Consultado el 10 de febrero de 2011 .
  67. ^ Nembaware, Victoria; Mazandú, Gastón K.; Hotchkiss, Jade; Safari Serufuri, Jean-Michel; Kent, Jill; Kengne, André Pascal; Anie, Kofi; Munung, Nchangwi Syntia; Bukini, Daima; Bitoungui, Valentina Josiane Ngo; Munube, Deogratias (1 de octubre de 2020). "La ontología de la anemia falciforme: permitir la investigación colaborativa y el codiseño de nuevas aplicaciones de salud planetaria". OMICS: una revista de biología integrativa . 24 (10): 559–567. doi :10.1089/omi.2020.0153. PMC 7549008 . PMID  33021900. 
  68. ^ Eilbeck K, Lewis SE , Mungall CJ, Yandell M, Stein L , Durbin R , Ashburner M (2005). "La Ontología de Secuencia: una herramienta para la unificación de anotaciones del genoma". Biología del genoma . 6 (5): R44. doi : 10.1186/gb-2005-6-5-r44 . PMC 1175956 . PMID  15892872. 
  69. ^ Niles, I. y Pease, A., (2001), Hacia una ontología superior estándar, en Actas de la segunda conferencia internacional sobre ontología formal en sistemas de información (FOIS-2001), Chris Welty y Barry Smith, eds, pp2 -9.
  70. ^ "DULCE" . Consultado el 11 de marzo de 2022 .
  71. ^ "SSN" . Consultado el 10 de noviembre de 2021 .
  72. ^ Mungall, CJ; Torniai, C; Gkoutos, GV; Lewis, SE; Haendel, MA (2012). "Uberon, una ontología anatómica integradora de múltiples especies". Genoma Biol . 13 (1): R5. doi : 10.1186/gb-2012-13-1-r5 . PMC 3334586 . PMID  22293552. 
  73. ^ "YAMATO". Archivado desde el original el 3 de marzo de 2011 . Consultado el 10 de febrero de 2011 .
  74. ^ "COLOR" . Consultado el 4 de mayo de 2011 .
  75. ^ "Biblioteca de ontología DAML" . Consultado el 10 de febrero de 2011 .
  76. ^ "Biblioteca ODP" . Consultado el 21 de febrero de 2013 .
  77. ^ "Biblioteca de ontología Protege" . Consultado el 10 de febrero de 2011 .
  78. ^ "EsquemaWeb". Archivado desde el original el 10 de agosto de 2011 . Consultado el 10 de febrero de 2011 .
  79. ^ "Fundición OBO" . Consultado el 10 de febrero de 2011 .
  80. ^ Smith, B .; Ashburner, M .; Rosse, C.; Bardo, J.; Error, W.; Ceusters, W.; Goldberg, LJ; Eilbeck, K.; Irlanda, A.; Mungall, CJ; Leontis, N.; Rocca-Serra, P.; Rutenberg, A.; Sansone, SA; Scheuermann, RH; Shah, N.; Whetzel, PL; Lewis, S. (2007). "The OBO Foundry: evolución coordinada de ontologías para respaldar la integración de datos biomédicos". Biotecnología de la Naturaleza . 25 (11): 1251-1255. doi :10.1038/nbt1346. PMC 2814061 . PMID  17989687.  Icono de acceso abierto
  81. ^ "Bienvenido al BioPortal NCBO | BioPortal NCBO". bioportal.bioontology.org . Consultado el 28 de marzo de 2019 .
  82. ^ "OntoSelect". Archivado desde el original el 11 de noviembre de 2010 . Consultado el 10 de febrero de 2011 .
  83. ^ "Ontaria" . Consultado el 10 de febrero de 2011 .
  84. ^ "Repositorio OpenOntology - OntologPSMW". ontologforum.org . Consultado el 28 de marzo de 2019 .
  85. ^ Khan, Zubeida Casmod; Keet, C. María (2013). "La biblioteca de ontología fundamental ROMULUS". Ingeniería de Modelos y Datos . Apuntes de conferencias sobre informática. vol. 8216, págs. 200–211. doi :10.1007/978-3-642-41366-7_17. ISBN 978-3-642-41365-0. S2CID  1925510 . Consultado el 25 de junio de 2023 .
  86. ^ Oberle, Daniel (2014). "Cómo las ontologías benefician a las aplicaciones empresariales" (PDF) . Web semántica . Prensa IOS. 5 (6): 473–491. doi :10.3233/SW-130114.
  87. ^ Frank, Andrew U. (2001). "Niveles de ontología y restricciones de coherencia en sistemas de información geográfica". Revista Internacional de Ciencia de la Información Geográfica . 15 (7): 667–678. Código Bib : 2001IJGIS..15..667F. doi :10.1080/13658810110061144. S2CID  6616354.
  88. ^ Stevenson, marca; Guo, Yikun (2010). "Desambiguación de términos biomédicos ambiguos utilizando ejemplos generados a partir del UMLS Metathesaurus". Revista de Informática Biomédica . 43 (5): 762–773. doi : 10.1016/j.jbi.2010.06.001 . PMID  20541624.
  89. ^ Bodenreider, O.; Mitchell, JA; McCray, AT (2003). "Ontologías biomédicas". Biocomputación 2004 . págs. 164-165. doi :10.1142/9789812704856_0016. ISBN 978-981-238-598-7. PMC  4300097 . PMID  15759615.

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