Cuando tenía trece o catorce años, estuvo durante un año en los categorías inferiores; pero por motivos de estudio y una lesión no continuó.Participó en un preselectivo para la selección que entrenaba José Chiarella con miras al Sudamericano Juvenil de 1979.Luego vino Pablo Villanueva, insistió y logró que Navarro firme por Muni, cuando era presidente Salomón Jabiles, quien fue su mentor.En 1981, logra la última gran campaña del Muni siendo subcampeones y clasificando a la Copa Libertadores de América, jugando con Eduardo Malásquez y Jaime Drago, esto le valió al veloz delantero para ser convocado por Tim al Mundial de España.En 1993 regresó a Deportivo Municipal; en 1994 tuvo un breve paso por Carlos Mannucci, de Trujillo, disputando solo 4 partidos y marcando 2 goles.Franco Navarro es considerado el último gran delantero de toda una generación del fútbol peruano.Debutó como entrenador en 1997 dirigiendo a Sport Agustino, de la segunda división,[6] luego en 1998 asumió interinamente en Sporting Cristal, con el que ganó el Torneo Clausura de ese año derrotando 1-0 en la final a Alianza Lima.Luego perdió la final por penales frente a Universitario en el segundo partido del play-off.En 1999 dirigió al cuadro bajopontino en la Copa Libertadores y todo el Torneo Apertura.Al año siguiente sus dirigidos ganaron el Torneo del Inca tras vencer 3-1 a Alianza Lima en la final.[7] Ese mismo año llegó a las semifinales del Campeonato Descentralizado 2015, en donde cayó ante Sporting Cristal por un resultado global de 6-5.
