[14]​ Con 16 participaciones internacionales en torneos oficiales organizados por la Confederación Sudamericana de Fútbol, es el cuarto conjunto peruano que ha disputado más copas continentales.

[24]​ Sin embargo, unos meses después, en junio del mismo año, el club cambió su nombre al actual FBC Melgar.

En el 2010 se vendió a Ysrael Zúñiga al Juan Aurich, Hilden Salas emigró al Cienciano y se contrató a Antonio Meza Cuadra proveniente de la Universidad César Vallejo, el equipo nunca encontró la regularidad y lamentablemente cedió muchos empates de local.

Con Wilmar Valencia ya como nuevo técnico, Melgar levantaría su rendimiento pero no del todo por lo que terminó peleando la baja en las 2 últimas fechas.

La penúltima era decisiva para el elenco arequipeño, que se enfrentaría al entonces puntero, y a la postre subcampeón del torneo, Alianza Lima.

El árbitro Víctor Hugo Carrillo hizo que se equipararan ligeramente las cosas al mostrarle la roja a Leandro Fleitas de Alianza Lima.

Un remate al travesaño de Renzo Reaños hacía parecer que ya nada entraría a ese arco.

Se contrató a Leao Butrón, el uruguayo Bosco Frontán, además del regreso de Ysrael Zúñiga y Edson Aubert, quienes tuvieron destacada actuación, entre otros.

Llegaba a la última fecha como líder del grupo, dependiendo de sí mismo para alcanzar la final aunque siendo perseguido por San Martín y César Vallejo.

El marcador no se movió más y Melgar volvió a quedar eliminado en primera fase de Copa Sudamericana tras casi concretar una remontada histórica.

La pretemporada dio inicio en enero, con amistosos ante la Escuela Municipal Deportivo Binacional, posteriormente realizó La Noche Rojinegra enfrentando a Universitario, empatando 0-0.

Melgar cerró la fase de grupos con 0 puntos, igualando a otros clubes peruanos con el mismo récord, como Alianza Lima, Deportivo Municipal, Sport Boys y Sporting Cristal.

[84]​[85]​ El motivo de su salida fue por temas familiares, poniendo fin a casi cuatro años al mando del club.

Melgar comenzó la temporada disputando el Torneo Apertura y la Copa Sudamericana, donde en primera fase enfrentaría a Nacional Potosí.

Los partidos oficiales comenzaron en marzo, teniendo que disputar el Torneo Apertura y la Copa Sudamericana, donde se enfrentaría al Carlos A. Mannucci en la ronda preliminar.

La tercera fecha la jugaba nuevamente en Lima, esta vez ante al rival más complicado del grupo, Athletico Paranaense.

A la quinta fecha llegaba igualado en puntos con Paranaense en la cima, mismo equipo al que tocaba enfrentar en Brasil.

Además, el buen rendimiento en este tramo del campeonato, hizo que en la tabla acumulada esté cerca de clasificar a la Copa Libertadores, sin embargo, la derrota en la última fecha ante Universitario se lo impidió, con lo cual terminó en quinta posición en la tabla acumulada, clasificando a la Copa Sudamericana por cuarto año consecutivo.

Dicho partido se jugó cuatro días después en Lima, donde volvería a ganar 2-0, esta vez con gol de Cuesta y nuevamente, Iberico.

[137]​ Tras otro empate de visita ante Huancayo,[138]​ se conseguiría la primera victoria del año (en el décimo duelo oficial), siendo un 1-0 como locales ante Cienciano.

[152]​ Los siguientes cinco partidos del Clausura posicionaron a Melgar como un candidato al título, ya que ganó en tres de ellos y tuvo otros dos empates.

[180]​[181]​ Marco Valencia asumiría interinamente por los siguientes dos partidos,[182]​[183]​ los cuales serían victorias: en casa 3-1 ante ADT[184]​ y de visita al líder Sporting Cristal por 2-1.

[213]​ En el siguiente cuadro se detalla la cronología del Foot Ball Club Melgar tanto en Posiciones a nivel de Liga Local, Nacional e Internacional.

Entre ellas destaca la nacional Lomas, Optimus, así como internacionales como Lotto, y actualmente la peruana Walon es la que viste al club desde el año 2016.

Herencia es el nombre que recibe esta camiseta, la cual rinde un homenaje a los inicios del club como "Juventud Melgar".

Distinta a la camiseta habitual, los colores rojo y negro se encuentran de manera invertida, inspirada en la camiseta usada en los comienzos del club, teniendo al escudo rodeado por el color rojo, el cual está resaltado por unos tintes un poco más oscuros, resaltados por todos los escudos usados en la historia del club.

El sentimiento se caracteriza por un gran amor al club y a Arequipa, tanto así que aún existen hinchas melgarianos radicando en otras ciudades del Perú, sobre todo en Lima.

El primer duelo oficial se dio en la fecha 3 del hexagonal final de la Copa Perú 1967, donde Melgar venció 2-1 en Lima.

En 2022 se enfrentaron por primera vez en torneos internacionales, específicamente en la ronda preliminar de la Copa Sudamericana, donde Melgar vencería por 2-1 en el marcador global.

Luis Ponce Arroé Moisés Chumpitaz Andrés Zegarra Emilio Barra Miguel Ángel Canziani Genaro Neyra Pablo Muchotrigo Christian Sotomayor A lo largo de la historia, FBC Melgar ha aportado jugadores para la Selección Peruana en diversas participaciones internacionales.