Cromosoma humano
El cromosoma 15 es uno de los 23 pares de cromosomas de los seres humanos . Normalmente, las personas tienen dos copias de este cromosoma. El cromosoma 15 abarca unos 99,7 millones de pares de bases (el material de construcción del ADN ) y representa entre el 3% y el 3,5% del ADN total de las células . El cromosoma 15 es un cromosoma acrocéntrico, con un brazo corto muy pequeño (el brazo "p", de "petite"), que contiene pocos genes codificadores de proteínas entre sus 19 millones de pares de bases. Tiene un brazo largo más grande (el brazo "q") que es rico en genes, abarcando unos 83 millones de pares de bases.
El gen del antígeno leucocitario humano para la β2-microglobulina se encuentra en el cromosoma 15, así como el gen FBN1, que codifica tanto la fibrilina-1 (una proteína fundamental para el correcto funcionamiento del tejido conectivo) como la asprosina (una pequeña proteína producida a partir de parte del ARNm del gen FBN1 transcrito), que participa en el metabolismo de las grasas.
Genes
Número de genes
Las siguientes son algunas de las estimaciones del recuento de genes del cromosoma 15 humano. Debido a que los investigadores utilizan diferentes enfoques para la anotación del genoma, sus predicciones del número de genes en cada cromosoma varían (para obtener detalles técnicos, consulte predicción de genes ). Entre varios proyectos, el proyecto de secuencia de codificación de consenso colaborativo ( CCDS ) adopta una estrategia extremadamente conservadora. Por lo tanto, la predicción del número de genes del CCDS representa un límite inferior en el número total de genes codificadores de proteínas humanas. [4]
Lista de genes
La siguiente es una lista parcial de genes en el cromosoma humano 15. Para ver la lista completa, consulte el enlace en el cuadro de información a la derecha.
- AAGAB : proteína fijadora de alfa y gamma-adaptina
- ACSBG1 : enzima codificante de la acil-CoA sintetasa, familia Bubblegum, miembro 1
- ADH1: alcohol deshidrogenasa
- ARHGAP11B : un gen específico humano que codifica la proteína activadora de la GTPasa Rho 11B, que amplifica los progenitores basales , controla la proliferación de los progenitores neuronales y contribuye al plegamiento del neocórtex .
- ARPIN : proteína codificante del inhibidor del complejo 2/3 de la proteína relacionada con la actina
- ARPP-19 : proteína codificante de la fosfoproteína 19 regulada por AMPc
- B2MR : proteína codificante reguladora de la beta-2-microglobulina
- C15orf15 : proteína codificante de la probable proteína de biogénesis del ribosoma RLP24
- C15orf32 : proteína codificante Proteína no caracterizada C15orf32
- C15orf54 : proteína codificante del cromosoma 15, marco de lectura abierto 54
- CAPN3 : Calpaína 3 (distrofia muscular de cinturas tipo 2A)
- CELF6 : proteína codificante del miembro 6 de la familia similar a Cugbp elav
- CHP : proteína de unión al calcio P22
- CHSY1 : Condroitín sulfato sintetasa 1
- CLK3 : quinasa tipo CDC 3
- ClpX : enzima codificante de la subunidad de unión a ATP de la proteasa Clp dependiente de ATP, similar a clpX, mitocondrial
- COMMD4 : proteína codificante que contiene el dominio COMM, proteína 4
- CPEB1 : proteína de unión al elemento de poliladenilación citoplasmática 1
- CRAT37 : proteína codificante de la transcripción asociada al cáncer de cuello uterino 37
- CYP19A1 : proteína codificante del miembro 1 de la subfamilia A de la familia 19 del citocromo p450
- DTWD1 :
- ELL3 : proteína codificante del factor de elongación ARN polimerasa II-like 3
- FAH : fumarilacetoacetato hidrolasa (fumarilacetoacetasa)
- FAM214A : proteína codificante Proteína FAM214A
- FBN1 : fibrilina 1 (síndrome de Marfan)
- FOXB1 : proteína codificante de la caja Forkhead B1
- GATM : Glicina aminotransferasa, mitocondrial
- GCHFR : proteína reguladora de retroalimentación de la ciclohidrolasa 1 de GTP
- GLC1I : proteína codificante del glaucoma 1, ángulo abierto, i
- GLCE : D-glucuronil C5-epimerasa
- GOLGA8H : proteína codificante del miembro 8H de la subfamilia A de Golgin
- HDGFRP3 :
- HEXA : hexosaminidasa A (polipéptido alfa) ( enfermedad de Tay-Sachs )
- HMG20A : proteína codificante de la proteína 20A del grupo de alta movilidad
- Proteína codificante IDDM3 Diabetes mellitus dependiente de insulina 3
- IMP3 : proteína codificante de la ribonucleoproteína nucleolar pequeña U3, proteína IMP3
- ITPKA : enzima codificante inositol-trifosfato 3-quinasa A
- IVD : isovaleril coenzima A deshidrogenasa
- KATNBL1 : proteína codificante KATNBL1
- KIAA1024 : proteína codificante Kiaa1024
- Proteína codificante LARP6, proteína relacionada con La 6, también conocida como acheron o miembro de la familia del dominio de ribonucleoproteína La 6 (LARP6),
- LCMT2 : enzima codificante de la leucina carboxil metiltransferasa 2
- Proteína codificante LINC00926 ARN codificante no proteico intergénico largo 926
- MESDC2 : proteína codificante de la chaperona LDLR MESD
- MESP1 : proteína codificante del homólogo del mesodermo posterior 1 (ratón)
- MFAP1 : proteína codificante de la proteína 1 asociada a microfibrillas
- MCPH4 : microcefalia, primaria autosómica recesiva 4
- MCTP2 : proteína codificante Múltiples dominios c2, transmembrana 2
- MIR7-2 : proteína codificante MicroRNA 7-2
- MIR1282 : proteína codificante MicroRNA 1282
- MIR627 : proteína codificante MicroRNA 627
- MIR9-3HG : proteína codificante del gen huésped MIR9-3
- NIPA2 : proteína codificante no impresa en la región del síndrome de Prader-Willi/Angelman, proteína 2
- NUSAP1 : proteína codificante de la proteína 1 asociada al huso y al nucleolar
- OCA2 : albinismo oculocutáneo II (homólogo de dilución de conjuntivitis, ratón)
- PDCD7 : proteína codificante Proteína de muerte celular programada 7
- PIF1 : proteína codificante PIF1 helicasa de ADN 5' a 3'
- PIGBOS1 : proteína codificante de la cadena opuesta 1 de Pigb
- PLA2G4D : proteína codificante del grupo IVD de la fosfolipasa A2
- PLA2G4E : proteína codificante de la fosfolipasa A2 grupo IVE
- PML : proteína de leucemia promielocítica (involucrada en t(15,17) con RARalpha, causa predominante de leucemia promielocítica aguda.
- POTEB : proteína codificante de la familia de dominios anquirina POTE, miembro B
- PTPLAD1 : enzima codificante de la proteína similar a la tirosina fosfatasa PTPLAD1
- PYGO1 : proteína codificante del homólogo 1 de Pygopus (Drosophila)
- RAD51 : Homólogo de RAD51 (homólogo de RecA, E. coli) (S. cerevisiae)
- RMDN3 : proteína codificante de la proteína reguladora de la dinámica de los microtúbulos 3
- RNR3 : ARN codificante, grupo ribosómico 45S 3
- RTF1 : proteína codificante Rtf1, componente del complejo Paf1/ARN polimerasa II, homólogo ( S. cerevisiae )
- RTFDC1 : proteína codificante del factor de terminación de la replicación 2
- SCAMP2 : proteína codificante Proteína de membrana asociada al transportador secretor 2
- SCAMP5 : proteína codificante Proteína de membrana asociada al transportador secretor 5
- SCZD10 : proteína codificante del trastorno esquizofrénico 10 (catatonia periódica)
- SCAPER : proteína asociada a la ciclina A en fase S que reside en el retículo endoplásmico
- SENP8 : enzima codificante de la proteasa 8 específica de Sentrin
- SERF2 : proteína codificante del factor 2 rico en EDRK pequeño
- SLC24A5 : el gen responsable de al menos 1/3 de las diferencias de color de piel entre razas, expresado en el cerebro y el sistema nervioso.
- SNAPC5 : proteína codificante de la subunidad 5 del complejo de proteína activadora del ARNmN
- SPN1 : proteína codificante Snurportin1
- STRC : estereocilina
- SUHW4 : proteína codificante de la proteína de dedo de zinc 280D
- SYNM : proteína codificante Synemin
- TEX9 : proteína codificante Proteína 9 expresada en testículos
- TGFBR2 : ubicación 3p24.2-p25 debido a una mutación de inactivación
- TMC3 : proteína codificante del canal transmembrana tipo 3
- TM6SF1 : proteína codificante del miembro 1 de la superfamilia Transmembrana 6
- TMCO5A : proteína codificante de los dominios transmembrana y superenrollado 5A
- TMED3 : proteína codificante de la proteína de tráfico transmembrana p24 3
- UBE2Q2 : proteína codificante de la enzima conjugadora de ubiquitina e2 q2
- UBE3A : proteína ligasa E3A de ubiquitina (proteína asociada a E6 del virus del papiloma humano, síndrome de Angelman)
- Ube3a-ATS :
- UNC13C : proteína codificante del homólogo C de Unc-13
- VPS39 : proteína codificante de la proteína similar a hVam6p/Vps39
- WDR76 : proteína codificante del dominio de repetición Wd 76
- ZNF592 : proteína codificante Proteína de dedo de zinc 592
Condiciones cromosómicas
Las siguientes enfermedades son causadas por mutaciones en el cromosoma 15. Dos de ellas ( síndrome de Angelman y síndrome de Prader-Willi ) implican una pérdida de la actividad genética en la misma parte del cromosoma 15, la región 15q11.2-q13.1. Este descubrimiento proporcionó la primera evidencia en humanos de que algo más allá de los genes podría determinar cómo se expresan los genes . [11]
Síndrome de Angelman
Las principales características del síndrome de Angelman son discapacidad intelectual grave, ataxia , falta de habla y actitud excesivamente alegre. El síndrome de Angelman es el resultado de una pérdida de actividad genética en una parte específica del cromosoma 15, la región 15q11-q13. Esta región contiene un gen llamado UBE3A que, cuando está mutado o ausente, probablemente causa los rasgos característicos de esta afección. Las personas normalmente tienen dos copias del gen UBE3A, una de cada progenitor. Ambas copias de este gen están activas en muchos de los tejidos del cuerpo. Sin embargo, en el cerebro solo está activa la copia heredada de la madre de una persona (la copia materna). Si la copia materna se pierde debido a un cambio cromosómico o una mutación genética, una persona no tendrá copias funcionales del gen UBE3A en el cerebro.
En la mayoría de los casos (alrededor del 70%) [ cita requerida ] , las personas con síndrome de Angelman tienen una deleción en la copia materna del cromosoma 15. Este cambio cromosómico elimina la región del cromosoma 15 que incluye el gen UBE3A . Debido a que la copia del gen UBE3A heredada del padre de una persona (la copia paterna) normalmente está inactiva en el cerebro, una deleción en el cromosoma 15 materno da como resultado que no haya copias activas del gen UBE3A en el cerebro.
En el 3% al 7% de los casos, [ cita requerida ] el síndrome de Angelman ocurre cuando una persona tiene dos copias del cromosoma 15 paterno en lugar de una copia de cada padre. Este fenómeno se llama disomía uniparental paterna (UPD). Las personas con UPD paterna para el cromosoma 15 tienen dos copias del gen UBE3A, pero ambas son heredadas del padre y, por lo tanto, están inactivas en el cerebro.
Alrededor del 10% de los casos de síndrome de Angelman son causados por una mutación en el gen UBE3A, y otro 3% es resultado de un defecto en la región del ADN que controla la activación del gen UBE3A y otros genes en la copia materna del cromosoma 15. En un pequeño porcentaje de casos, el síndrome de Angelman puede ser causado por una reorganización cromosómica llamada translocación o por una mutación en un gen distinto del UBE3A. Estos cambios genéticos pueden inactivar anormalmente el gen UBE3A.
El síndrome de Angelman puede ser hereditario, como lo demuestra un caso en el que una paciente quedó embarazada de una hija que también padecía la enfermedad. [12]
Síndrome de Prader-Willi
Las principales características de esta afección incluyen polifagia (apetito extremo e insaciable), retraso leve a moderado del desarrollo, hipogonadismo que resulta en pubertad tardía o nula e hipotonía . El síndrome de Prader-Willi es causado por la pérdida de genes activos en una parte específica del cromosoma 15, la región 15q11-q13. Las personas normalmente tienen dos copias de este cromosoma en cada célula, una copia de cada progenitor. El síndrome de Prader-Willi se produce cuando la copia paterna falta parcial o totalmente.
En aproximadamente el 70% de los casos , el síndrome de Prader-Willi se produce cuando se elimina la región 15q11-q13 del cromosoma 15 paterno. Los genes de esta región normalmente están activos en la copia paterna del cromosoma y están inactivos en la copia materna. Por lo tanto, una persona con una eliminación en el cromosoma 15 paterno no tendrá genes activos en esta región.
En aproximadamente el 25% de los casos, una persona con síndrome de Prader-Willi tiene dos copias maternas del cromosoma 15 en cada célula en lugar de una copia de cada progenitor. Este fenómeno se denomina disomía uniparental materna. Debido a que algunos genes normalmente están activos solo en la copia paterna de este cromosoma, una persona con dos copias maternas del cromosoma 15 no tendrá copias activas de estos genes.
En un pequeño porcentaje de casos, el síndrome de Prader-Willi no es causado por una reorganización cromosómica llamada translocación. En raras ocasiones, la afección es causada por una anomalía en la región del ADN que controla la actividad de los genes en el cromosoma paterno 15. Debido a que los pacientes casi siempre tienen dificultades para reproducirse, el síndrome de Prader-Willi generalmente no es hereditario.
Cromosoma isodicéntrico 15
Un cambio cromosómico específico llamado cromosoma isodicéntrico 15 (IDIC15) (también conocido por otros nombres) puede afectar el crecimiento y el desarrollo. El paciente posee un cromosoma "adicional" o "marcador". Este pequeño cromosoma adicional está formado por material genético del cromosoma 15 que se ha duplicado (copiado) de forma anormal y se ha unido de extremo a extremo. En algunos casos, el cromosoma adicional es muy pequeño y no tiene ningún efecto sobre la salud de la persona. Un cromosoma 15 isodicéntrico más grande puede provocar tono muscular débil (hipotonía), discapacidad intelectual, convulsiones y problemas de conducta. [13] Los signos y síntomas del autismo (un trastorno del desarrollo que afecta la comunicación y la interacción social) también se han asociado con la presencia de un cromosoma 15 isodicéntrico.
Otras condiciones cromosómicas
Otros cambios en la cantidad o la estructura del cromosoma 15 pueden causar retrasos en el desarrollo, retraso en el crecimiento y el desarrollo, hipotonía y rasgos faciales característicos. [ cita requerida ] Estos cambios incluyen una copia adicional de una parte del cromosoma 15 en cada célula (trisomía parcial del cromosoma 15) o la falta de un segmento del cromosoma en cada célula (monosomía parcial del cromosoma 15). En algunos casos, se eliminan o duplican varios de los componentes básicos del ADN del cromosoma (nucleótidos).
Las siguientes enfermedades son algunas de las relacionadas con los genes del cromosoma 15: [ cita requerida ]
Banda citogenética
Referencias
Referencias específicas:
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Enlaces externos
Wikimedia Commons alberga una categoría multimedia sobre Cromosoma humano 15 .
- Institutos Nacionales de Salud. «Cromosoma 15». Genetics Home Reference . Archivado desde el original el 3 de agosto de 2004. Consultado el 6 de mayo de 2017 .
- «Cromosoma 15». Archivo de información del Proyecto Genoma Humano 1990–2003 . Consultado el 6 de mayo de 2017 .