Su término municipal ha estado poblado desde la prehistoria, pues posee una gran muestra de pinturas rupestres, siendo las más famosas las que se encuentran en la cueva del Vercialejo, así como posteriormente estelas del primer milenio a. C. Se han encontrado restos de asentamientos prerromanos, romanos y árabes.

A la caída del Antiguo Régimen la localidad se constituye en municipio constitucional en la región de Extremadura.

[3]​ La Guerra Civil española ocasionó grandes daños en la villa, construyéndose a partir de agosto de 1941 Zarza Capilla Nueva, que no comenzó a poblarse hasta 1943, aunque la población se repartió entre los dos núcleos.

La población se desplazó lejos del pueblo y no volvió hasta acabada la guerra.

Los edificios más representativos están en Zarza Capilla Vieja y son la Iglesia de San Bartolomé originaria del siglo XVI.

En 1983 se construyó en el paraje de Los Pocitos una pequeña ermita en honor a San Isidro, proyectada por Eugenio Sánchez Fernández.