En lo referente a sus recursos hídricos, el municipio se encuentra surcado por numerosos ríos pertenecientes a la cuenca del río San Juan del Oro.
Asimismo, la reserva biológica de Sama presenta una notable belleza natural por su gradiente pronunciada.
Existen, además, paisajes cordilleranos y profundos valles mesotérmicos.
En lo referente a su fauna, destacan especies como vicuña, llama, cóndor, viscacha y avifauna acuática.
Para promover el desarrollo productivo, Yunchará cuenta con el apoyo de entidades públicas y privadas.