Está ubicada sobre la Ruta 1, que conduce desde Tarija hacia Bermejo, sobre la frontera con la Argentina.

Una de las teorías de la palabra Padcaya es que posiblemente venga del "Pacay", "Pacaya" o "Pacae", árbol y fruto (Inga feuilleei) que se ubica en gran magnitud en la Selva de Tariquía y zonas cercanas del cantón Padcaya, la palabra "Pacaya" posiblemente se distorsionó y se transformó en "Padcaya".

[3]​ La topografía del municipio es irregular, con sectores montañosos rodeados de paisajes de valles situados entre los 1.660 y 2.200 msnm, donde se destacan los valles comprendidos entre Padcaya, Rosillas y Orozas.

[4]​ Los ríos que atraviesan el municipio son los principales afluentes del río Bermejo: Salado, Emborozú, Orosas y Condado.

Entre los principales idiomas indígenas están: El municipio se divide en 13 distritos municipales: El clima de Padcaya puede ser clima estepario templado (BSk) en partes del oeste y centro, también clima templado subhúmedo (Cwb) en el centro y partes del oeste, clima subtropical subhúmedo (Cwa) en el este y partes del centro y de la capital del municipio, pero clasifica del tipo clima templado con invierno seco (Cwb), de acuerdo con la clasificación climática de Köppen.