Creado en 1987 por una unión de grupos indígenas que lideraban una lucha armada contra el régimen sandinista.

Defendía los intereses autóctonos y regionales de los pueblos indígenas que viven en Nicaragua.

En los territorios habitados por indios se crearon comités sandinistas que asumieron funciones administrativas.

Las fuerzas gubernamentales llevaron a cabo varias operaciones militares importantes, pero no pudieron reprimir la resistencia.

Los guerrilleros, que conocían bien el terreno, arrastraron a los sandinistas a combates agotadores, evitando la batalla decisiva.La infantería se ahogó en pantanos, llevaba artillería y destacamentos de rebeldes miskitos escaparon en canoas ligeras.

Sin embargo, los dirigentes indios prefirieron llevar a cabo sus propias negociaciones con las autoridades del Frente Sandinista de Liberación Nacional.

YATAMA acordó coordinar con el gobierno el uso de los recursos económicos y cumplir con la legislación nacional.

En el año 2000 , la ciudad capital de la RAAN, Puerto Cabezas, se vio envuelta en disturbios.

[11]​ Sin embargo, la alianza con el FSLN permitió a YATAMA regresar al gobierno regional.

No por el número de votos, sino por mejorar la imagen y aumentar el prestigio.

Ahora quieren nuevamente aplastar nuestro movimiento y tomar el control de los territorios.

Los líderes de la comunidad misquita en Estados Unidos, Elacio Holmes y Carlos Rivas Tomás, condenaron duramente las políticas del gobierno sandinista y advirtieron sobre una posible reanudación de la lucha armada.