A pesar de esto, Fagoth inicialmente apoyó la Revolución Sandinista y se unió al FSLN.

Sin embargo, rápidamente entró en conflicto con la dirección sandinista, porque no aprobaba la política de unificación orientada hacia los miskitos.

[3]​[1]​ Steadman Fagoth formó la organización MISURA y las fuerzas armadas del Frente Atlántico a partir de indios antisandinistas.

Fagoth abogó por la cooperación político-militar con otras estructuras de la Contra, principalmente con la Fuerza Democrática Nicaragüense (FDN).

Durante todo el período de la guerra civil, hubo una lucha por el liderazgo entre Steadman Fagoth y Brooklyn Rivera, quien encabezaba la organización MISURASATA.

[7]​ En 1987, KISAN se fusionó con MISURASATA para formar el movimiento YATAMA bajo el liderazgo de Brooklyn Rivera.

[9]​ Steadman Fagoth pertenece a esa parte de los veteranos del movimiento Contra que aceptaron la reconciliación y la cooperación con los sandinistas.

La relación entre Fagoth y Ortega se consideraba una simpatía mutua de larga data.

Fagoth aprobó esta decisión y anunció que tenía otros planes de negocios.

Sin embargo, según algunos expertos, las razones fueron la corrupción y el favoritismo practicado por Fagoth, la concesión de importantes preferencias a las empresas pesqueras miskitas sobre otras estructuras empresariales.[10]​.