El vicariato apostólico del Pilcomayo (en latín: Vicariatus Apostolicus Pilcomayoënsis) es una circunscripción eclesiástica de la Iglesia católica en Paraguay.
Se trata de un vicariato apostólico latino, inmediatamente sujeto a la Santa Sede.
El vicariato apostólico tiene 125 000 km² y extiende su jurisdicción sobre los fieles católicos de rito latino residentes en el departamento de Boquerón y en la parte septentrional del departamento de Presidente Hayes hasta el río Monte Lindo.
La sede del vicariato apostólico se encuentra en la ciudad de Mariscal José Félix Estigarribia, en donde se halla la Catedral de Santa María.
[2] El 14 de julio de 1950 la prefectura apostólica fue elevada a vicariato apostólico con la bula Si per Evangelii del papa Pío XII.