Valle de Comayagua

En cuanto a la fauna silvestre destaca la presencia de pequeños mamíferos como las zarigüeyas y los armadillos.

Durante el cenozoico empezó a ser habitada por la fauna de la época como el Mamut columbino, Mastodontes, osos perezosos gigantes, entre otras especies.

Esto también logró evidenciarse gracias a que se han encontrado fósiles de estos animales como podrían ser molares, quijadas, huesos, y colmillos.

[6]​ La presencia humana en el valle data desde hace más de 12 000 años no obstante la primera sociedad bien organizada con un urbanismo complejo que se tenga conocimiento del valle fueron los pobladores de el Chircal.

Debido a la actividad volcánica la ciudad fue abandonada por sus pobladores aunque eso no quita que diversos asentamientos siguieron fundándose alrededor de ella.

Diversos estudios ha dado como resultado las ruinas o cimientos de pequeñas iglesias coloniales que funcionaron como capillas para los indígenas así como los restos de pequeñas aldeas o pueblos que fueron deshabitadas.