Siendo joven, participó en manifestaciones contra la dictadura del general Franco y simpatizó con grupos de la denominada izquierda abertzale.

[3]​ Durante la consiguiente estancia en la cárcel, contrajo matrimonio con Izaskun Larreategi,[2]​ con quien compartía similares posicionamientos políticos.

Al salir de prisión en 1976 como consecuencia de la amnistía decretada a la muerte del general Franco[4]​ trabajó dos años en la construcción[5]​ y se unió a los Abertzale Sozialista Komiteak (ASK) —Comités Patriotas Socialistas, en idioma vasco—[2]​ una organización de masas de la izquierda abertzale que trabajaba con movimientos vecinales y que pronto se vinculó a la Koordinadora Abertzale Sozialista (KAS).

Desde su nuevo cargo, Ziluaga trasladaría con éxito a la coalición nacionalista las directrices de una KAS cada vez más controlada por ETA militar.

También utilizaría a la militancia de HASI (partido todavía no legalizado) para controlar el sindicato nacionalista LAB, y los recursos de la organización terrorista para controlar el diario Egin.

[9]​ Además, la unanimidad existente en el partido se evidenció en su II Congreso, celebrado en septiembre de 1983 en Rentería, que reeligió a Ziluaga como secretario general.

A partir de ese momento, al quedar vacante la presidencia, el papel del secretario adquirió todavía mayor peso.

[20]​ Como resultado del enfrentamiento, HASI perdió importancia dentro de Herri Batasuna, y esta se configuró más como un partido político (cosa que ya era legalmente desde su inscripción en el registro de partidos en 1986).

[4]​ La ilegalización de Batasuna en 2003 y la consiguiente pérdida de una organización legal que diera cobertura al movimiento político propició que Ziluaga y otros veteranos dirigentes fueran rescatados para realizar legalmente ciertas convocatorias.

Otegi puso a Ziluaga como ejemplo de militante comunista y abertzale (patriota, en euskera), afirmando también que jamás le oyó «explicitar sus críticas en público si con ello podía dañar a la izquierda abertzale» y que «no fue perfecto».

[3]​ La carta fue leída por Periko Solabarria, compañero de Ziluaga en Herri Batasuna durante años.