Se encuentra sobre la calzada homónima, a la que da el nombre.
Irónicamente, la estación homónima del metro no es la más cercana a la iglesia, sino Pino Suárez.
Debido a ello, fray Juan Domínguez Araoz, nuevo comendador, decidió levantar una nueva, obra que duró de 1687 a 1694 y la dejó con un techo de artesonado.
La disposición llegó en 1791 a México, siendo comendador del hospital fray Santiago María.
Se les permitió a él y a los religiosos permanecer en las instalaciones, ya subordinadas como capilla mayor de la parroquia de Santa Cruz Acatlán, siempre y cuando pasasen al clero secular.