Tras varios meses de lucha fue derrotado y decapitado por su primo, Taira no Sadamori.
[1] Su cabeza fue llevada de vuelta a Kioto y fue expuesta en exhibición como "castigo ejemplarizante".
Tras su muerte, Taira no Masakado fue deificado, siendo considerado un héroe y un semidiós.
Hay otros santuarios que aseguran tener otras partes del cuerpo y reliquias de Masakado, incluyendo; el torso, las manos, partes de los brazos, sus armaduras, etc.[3] Existen leyendas de apariciones del fantasma de Taira no Masakado por los alrededores del santuario y del distrito de Otemachi, incluso se asegura que dichas "apariciones" han provocado diversas calamidades a la gente del lugar, como epidemias y desastres naturales, tras considerarse que había sido deshonrada su memoria.
Su estatus de deidad en el santuario Kanda Myojin fue revocado, sin embargo la devoción a Taira no Masakado resultó ser tan popular entre la gente común, que su estatus fue devuelto simbólicamente al santuario después de la Segunda Guerra Mundial.