En las últimas décadas del siglo XX se desarrolló la siembra intensiva de flores para exportación.

El topónimo «Subachoque» en muysc cubun (idioma muisca) significa «frente de trabajo».

[4]​ Subachoque presenta los vocablos su-sua "sol", ba "digno", uba "rostro, semilla, flor".

El municipio se denominó así con relación en la comunidad indígena que habitó la región perteneciente a la familia lingüística chibcha.

Cuando llegaron los conquistadores encontraron una población que disfrutaba de su territorio fértil con abundante caza y pesca.

Junia significa poderoso y tamix era el arma o macana que utilizaban los guerreros.

Junto al Tablazo se encuentra la pequeña cuenca hidrográfica llamada el Pantano de Arce.

Aunque los árboles, arbustos y matorrales fueron talados, este hermoso lugar sigue siendo uno de los predilectos por los turistas.

En vista de que ese territorio montañoso no era propicio para construir casas, César Latorre le donó al religioso el solar donde se comenzó a edificar el actual municipio.

Para la época, la región ya contaba con 750 habitantes y el mercado semanal de productos agrícolas adquiría cierta importancia.

También se destaca la vía hacia la inspección de La Pradera, una ruta con columpios cortos que permite acceder a caminos rurales que conducen a las veredas El Guamal, Rincón Santo, Cascajal, El Tobal y La Unión, y que llega hasta el municipio de Zipaquirá.

El municipio cuenta con la emisora radial local Subachoque Stereo, que se puede sintonizar en los 94.4 F.M.

Son sus suelos riqueza ecológica Patrimonio y tesoro ambiental; Sus entrañas producen las mieses Que sustentan a un pueblo ideal.