Sonic hedgehog
Para que una proteína hedgehog sea funcional debe estar acoplada a una molécula de colesterol.El patrón ventral está determinado por la secreción de la proteína sonic hedgehog en el notocordio.El segundo paso, regulado igualmente por la secreción de Shh, esta vez en la placa del piso del tubo neural, indica a las neuronas ventrales que se conviertan en neuronas motrices, y no en interneuronas.Alteraciones en el gen Shh, junto con genes como ASPM, NCAM y microcephalin, pueden afectar el crecimiento del cerebro en humanos y otros vertebrados causando microcefalia, ya que se expresan en zonas donde ocurre la neurogénesis.[11] Estos genes han sido seleccionados positivamente durante la evolución de los humanos, dando como resultados mayor crecimiento del cerebro en comparación a otros primates como chimpancés, orangutanes y gorilas.[12] El fenómeno de muerte celular programada, apoptosis, está mediado por proteasas llamadas caspasas.Estas digieren la célula desde el interior, cortando proteínas celulares y fragmentando el ADN.En el tubo neural del pollo, la proteína receptora de hedgehog Patched, activa las caspasas.Este nudo secreta una gran variedad de factores paracrinos, entre los cuales están Shh, BMP2, BMP4, BMP7, y FGF4.[18] La osificación endocondral, un proceso que se da en la columna, costillas, pelvis y extremidades, involucra la formación de tejido cartilaginoso a partir e células mesenquimales y el posterior reemplazo del cartílago por hueso.Cuando el tubo intestinal empieza a formarse en los extremos anterior y posterior, induce la especialización regional del mesodermo esplácnico, donde Shh está involucrado.En las etapas más tempranas del desarrollo la expresión de Shh está limitada al intestino posterior y a la faringe.Su expresión desigual a través de todo el tubo delimita las zonas del mesodermo que rodea el intestino.[29] La especialización de los somitas se lleva a cabo por la interacción entre varios tejidos.La parte ventral media del somita, es inducida a diferenciarse en esclerotoma por factor paracrinos entre los cuales se destaca Sonic hedgehog.[30][31] El esclerotoma dará origen posteriormente a partes de la columna vertebral y la mayoría del cráneo.[32][33] Shh se expresa a lo largo de todo el endodermo intestinal, excepto en la región del páncreas.[43] Sonic Hedgehog (Shh) y BMP poseen interacciones complejas en la formación de las plumas.