La flota de trenes de la Serie 400 fue arrendada por JR Este a la empresa propietaria, Yamagata JR Chokutsū Tokkyū Hoyū Kikō (山形ジェイアール直通特急保有機構(株), Yamagata JR Chokutsū Tokkyū Hoyū Kikō?

[1]​ Originalmente eran conjuntos de seis coches, pero en 1995 se agregó un séptimo coche (tipo 429) a cada conjunto debido a la popularidad de los nuevos servicios Tsubasa.

Sin embargo, fueron renovados y repintados entre 1999 y 2001, con un área más alta de gris azulado oscuro en la parte inferior, llegando casi hasta las ventanas laterales y separadas del gris plateado con una franja verde.

Los espacios libres se redujeron mucho en comparación con las líneas Shinkansen anteriores y, por lo tanto, las unidades de la Serie 400 eran mucho más estrechas que los trenes Shinkansen anteriores.

La distancia entre asientos era de 1160 mm (45,7 plg) en la Clase Verde (coche 11), de 980 mm (38,6 plg) en los coches con asientos reservados (12 a 15) y de 910 mm (35,8 plg) en los coches sin reserva (16 y 17).

[8]​ Las bajas en el servicio comenzaron en diciembre de 2008, con el primer tren, el L1.