Luego fue asignado como comisario al departamento político del Ejército Laborista de Donetsk.
Pronto se retractó de su confesión, afirmando que la hizo bajo coacción.
En septiembre, Rúdnev formó un grupo partisano en su localidad natal de Putivl.
En octubre, el destacamento partisano de Rúdnev y Sydir Kovpak se unió en una sola unidad, y Rúdnev se convirtió en comisario de la nueva unidad con Kovpak como su comandante.
Rápidamente se ganó el respeto entre los combatientes partisanos y siguió siendo el comisario de Kovpak mientras su grupo inicialmente pequeño se convirtió en una formación grande y bien organizada que atacaba la retaguardia de los ocupantes nazis.
Sin embargo, el historiador estadounidense David M. Glantz afirma que Rudniev fue asesinado mientras el grupo partisano se retiraba después de efectuar un ataque contra Deliatin.
[6] Posteriormente fue vuelto a enterrar en Yaremche (en el óblast de Ivano-Frankivsk en Ucrania).
Basándose en los archivos soviéticos, algunos investigadores alegaron que Rúdnev no estaba comprometido con la estrategia y los enfoques (especialmente con respecto a los civiles) dictados por el Cuartel General del Movimiento Partisano de Ucrania con sede en Moscú.
Según estos investigadores, Rúdnev estaba intentando colaborar con las fuerzas del Ejército Popular de Ucrania.