De tales dos regiones se fundaron los 78 municipios que la isla contiene actualmente (2018).
Tuvo que mudarse varias veces y por eso se le conoce como ciudad fundadora de pueblos.
La construcción de un fortín para proteger al pueblo comenzó en 1540, pero en 1546 cuando la población, cansada de ataques, comienza a mudarse tierra adentro una vez más, y la construcción del fortín fue suspendida.
En el 1540 se construyó una fortaleza y se determinó que los vecinos de San Germán trasladaran sus casas tierra adentro, y otros comenzaron a establecerse en las Lomas de Santa Marta para el 1543.
Por los ataques ingleses y franceses se mudan de nuevo esta vez a la Lomas de Santa Marta donde se radicaron definitivamente en 1573 y su primer alcalde fue Don Rodrigo Ortiz Vélez.
Tiene una gran plaza cuadrada y dos calles que se extienden hasta el convento de Santo Domingo”.
Continúa diciendo el religioso “Su vicario tiene jurisdicción en todo su territorio, hasta los ríos Jacaguas y Camuy.
Para el 1871 se instaló el telégrafo y seis años después San Germán recibe el título de Ciudad, otorgado por su Majestad Alfonso XII.
Al próximo año salió el primer periódico en esta ciudad - “El Eco de la Lomas”.
Para fines del siglo XIX San Germán era muy posiblemente el centro cultural de Puerto Rico.
Primer cuarto: Mitra y bastón en un campo verde representando a Germán de Auxerre, el santo patrón del pueblo.
Porta Coeli hoy sigue siendo una atracción importante que atrae miles de turistas locales e internacionales.
Plaza del Oeste es el centro comercial de mayor envergadura en la ciudad, y contiene los siguientes tiendas: Establecimientos Anclas: Supermercados Econo, Kmart Otros establecimientos: Mike's Steak House, la pizzeria y restaurante Palermo, McDonalds, Walgreens, El Mesón (Sándwiches), La Gran Vía, Quality Gym & San Germán Tae-Kwon-Do Institute, Sally's Beauty Supplies, Banco Popular de Puerto Rico, Banco Santander KFC, Foot Locker, Radio Shack , Caribbean Cinemas, sala de cine con 7 salas y Ferretería Santana Inc.
En el centro del pueblo se encuentra La Farmacia Martin la cual lleva sobre 80 años dando servicio.
Fue la primera universidad privada de Puerto Rico, y aún se conoce por introducir el maravilloso juego del Baloncesto a los puertorriqueños, por cual razón se conoce hoy a San Germán como la "Cuna del Baloncesto Puertorriqueño".