Se presentó a la presidencia por el efímero Partido de Unificación Social Demócrata, como candidato prácticamente único; sus contendientes se retiraron de la carrera electoral cuando la campaña ya estaba en curso.

En atención a que el Ministro y Subsecretario de Relaciones Exteriores, doctor Arturo Argüello Loucel y el licenciado Miguel Ángel Espino estaban fuera del país, acordó encomendar ad-honorem el despacho de ese ramo al doctor José Gómez Molina mientras dure la licencia de los funcionarios.

Firmó el Pacto de Santa Ana con Juan José Arévalo en 1945, y aunque se avanzó poco en el tema, siguió impulsando la idea.

En 1948 la Asamblea Legislativa recortó el periodo presidencial a cinco años, y emitió un decreto para que Castaneda abandonara el gobierno un año después, recortando su periodo a sólo cuatro años.

Castaneda, quien al parecer buscaba la reelección, alegó que el decreto no podía ser retroactivo, y anunció su intención de prolongar su mandato hasta el límite constitucional vigente cuando tomó posesión.