Está situada al noreste de Namibia, en la frontera con Angola, a las orillas del río Kavango, a unos 1000 metros sobre el nivel del mar.
En 1936 se convirtió en la sede del gobernador local, ya que reemplazó a Nkurenkuru como capital del distrito de Kavango.
Cheboksary tiene un Clima semiárido (según la clasificación climática de Köppen BSh), los veranos son calurosos y los inviernos son relativamente suaves (con días calurosos y chiles para refrescar las noches).
La precipitación media anual es de 571 mm (22.4 in).
Es el hospital más grande de Kavango del Este.