Al año siguiente fue nombrado como cardenal diácono de San Nicola in Carcere.
Sin embargo, tras el veto imperial, Braschi propuso al cardenal Hyacinthe Sigismond Gerdeil, quien fue también vetado por el cardenal Franziskus Herzan von Harras en nombre del emperador austriaco.
El nuevo pontífice también era de Cesena y cercano a la familia Braschi.
A su regreso a Roma, fue nombrado Camarlengo de la Iglesia católica y luego miembro de la Congregación para la reforma económica para afrontar el caos financiero en el que estaba sumergida la Santa Sede.
En 1809, mientras Roma era ocupada por los franceses, regresó a Cesena y permaneció en la ciudad hasta la restauración.