Los romanos dominaron el río hasta Valentiniano I (364-375) salvo unos años muy fríos (256 a 259, cuando las bases y muchas de las embarcaciones fueron tomadas por sorpresa).

Durante estas grandes invasiones, en la antigua frontera romana, en medio de esas nuevas poblaciones, pequeñas comunidades romances: los Walcheren, Welschenlants, Walchengaue o Valachies (que los historiadores llaman romaníes populares), se mantienen en los macizos forestales ((Ardenas, Vosgos: valones y galeses) o montañoso (Alpes: romanches, ladinos; Cárpatos y Balcanes: válacos).

También se debe subrayar el papel del río durante la guerra de la Quinta Coalición en 1809, que vio a Austria oponerse al emperador Napoleón I.

Al hacerlo, captura las aguas europeas que fluyen hacia el norte y separa ciertas partes del sur de Alemania en dos.

Sin embargo, es probable que la integración europea sirva para derribar todos los obstáculos creados por esta heterogeneidad y haga aumentar considerablemente su importancia económica como ruta natural.

[Nota 5]​ El Danubio se encamina primero en dirección suroeste, pasando por las pequeñas localidades de Pfohren y Neudingen (aprox.

Sigue su avance llegando a Rechstein, y tras recibir por la izquierda al Grobe Lauter, pasa por las pequeñas localidades de Obermarchtal (1311 hab.)

En territorio austriaco, el curso del Danubio está marcado por la construcción de once presas hidroeléctricas, que han remansado grandes extensiones.

Sigue su lento avance frente a pequeños pueblos, primero Dietzendorf y Pyrawang (AUT), luego Obernzell (ALE, con 3763 hab.)

Pasada Linz, el Danubio recibe por la derecha al río Traun (153 km), casi en cuya confluencia está la ciudad de Ebelsberg (10 804 hab.)

En esa sección fronteriza el río discurre por una vega muy fértil, pasando frente a Au an der Donau (908 hab.

Justo después llega a la pequeña localidad de Persenbeug, enfrentada, en la otra orilla, ante Ybbs an der Donau (5627 hab.

La ciudad toma su nombre de un afluente, el Viena (Wienfluss), que se une al Danubio en este punto.

Viena es también la sede de la Comisión Internacional para la Protección del Danubio (Internationale Kommission zum Schutz der Donau, IKSD), fundada en 1998.

El Danubio se adentra enteramente en Eslovaquia al alcanzar la pequeña llanura húngara (Malá dunajská kotlina), a las afueras de Bratislava (437 725 hab.

Šamorín finalmente perdió su derecho al estatus de ciudad real libre otorgado en 1405 durante el reinado del rey húngaro Segismundo.

Está localizada sobre el importante eje carretero que une Budapest y Viena, a medio camino de ambas.

), ahora suburbios de la capital, para ser nuevamente límite intercondal, está vez entre Fejér (E) y Pest (O).

Esos 1075 km, o aproximadamente un tercio de su longitud total,[48]​ hacen que Rumania tenga la parte más larga del río.

De los doce puertos búlgaros en el Danubio, los más importantes son Vidin, Lom, Oryahovo, Nikópol, Svishtov, Ruse, Tutrakan y Silistra.

En la ciudad está el Monumento de Hristo Botev y una réplica del vapor-museo Radetzky, ambos considerados sitios turísticos nacionales.

En la orilla opuesta desde Oryahovo, está Ostrov, lugar donde desembarcó Hristo Botev con sus insurgentes, y luego recibe por la derecha al río Iskar (368 km), en Gigen (1984 hab.)

Este ramal, menos poblado, pasa frente a Ostrov, Izvoarele, Oltina, Dunăreni, Rasova, Cochirleni y Cernavodă (17 022 hab.).

Este ramal pasa frente a las localidades de Ostrov, Gârliciu, Dăeni, Peceneaga, Turcoaia, Carcaliu, Măcin y Brăila (216 929 hab., capital del distrito homónimo.

Están listadas desde el nacimiento del río hasta su final y los habitantes corresponden a los censos más recientes.

Ello sin contar con las lenguas habladas por las tribus nómadas que poblaron la región desde los tiempos prehistóricos, como es el caso de los celtas y otros pueblos indoeuropeos primitivos.

Algunos topónimos de origen celta, como es el caso del río Isar, pueden servir para corroborar esta idea.

Existe una ruta cicloturista por el Danubio que, aprovechando en parte una antigua calzada romana, facilita recorrer 2857 kilómetros del río en bicicleta.

Los peces típicos del Danubio son barbo común, naso, bagre, leucisco, plática, carpa común, brema blanca, lucio, lucioperca, percomorfo, anguila europea, Aspius aspius, salmón del Danubio, esturión esterlete y siluro europeo y rodeus, gobio, Misgurnus, schraetzer, zingel y streber, el especies de esturión que a diferencia del pasado, debido a la construcción de la presa en la Puertas de Hierro, ya no pueden llegar a Viena.

El sensible sistema de aguas subterráneas que es importante para las llanuras aluviales del Danubio podría verse afectado por la construcción.