Nació en el año 399 en Constantinopla, como nieta del emperador Teodosio I,[3]​ hija del emperador Arcadio y Eudoxia, era hermana del emperador Teodosio II; su hermana Flacilla, la mayor, murió muy joven, mientras que sus hermanas Arcaia y Marina eran menores que ella.

En esta época, Pulqueria hizo un voto de virginidad, que mantuvo hasta el fin de sus días, e invitó a sus hermanas que hicieran lo mismo, no precisamente por motivos religiosos, sino por motivos políticos, para impedir que un político o militar aprovechase su estirpe para entrometerse en la política imperial.

Por tanto, Pulqueria fue llamada del exilio, aunque habían pasado 10 años de mal gobierno.

El papa León Magno, en 449 acudió a Pulqueria y al emperador Teodosio II para que rechazasen el monofisismo.

Pulqueria quiso influir en su hermano, para mantener dentro de la ortodoxia religiosa impulsada por el papa, pero no lo logró.