[6]​ Pedro Alonso también descubrió, en un viaje posterior a Paria, la Isla Margarita y la Punta de Araya, en las Antillas Menores.

Fue creciendo en el ambiente marinero de su familia, formándose como marino hasta adquirir amplia experiencia.

[8]​ Estuvo casado dos veces: la primera con Juana Muñiz, de cuya unión nacieron Juan Niño, Isabel Quintero y Leonor Fernández, y después se casó con Leonor de Boria, con quien tuvo a Francisco Niño.

Los Niño, una vez superados los primeras reticencias al proyecto de Colón, se convirtieron en férreos defensores del viaje, y pusieron todo su empeño en llevar a cabo la empresa Colombina.

[9]​ Pedro Alonso Niño planteó realizar una expedición[11]​ particular a las tierras recién descubiertas, en la Costa de las Perlas (Paria), la cual había dejado deslumbrados a los exploradores de los primeros viajes colombinos.

[12]​ El último viaje que realizó, lo hizo en la flota del nuevo gobernador Nicolás de Ovando, en cuyo rol lo encontramos como piloto de resguardo, y no como piloto mayor, cargo para el que fue elegido al parecer por el propio Fonseca.

Pedro Alonso Niño fue añadido por orden expresa de la Corona como piloto extraordinario de la capitana “Santa María del Antigua”, además del piloto normal Diego Ortiz.