Fue sobrino del también obispo de Córdoba el cardenal Salazar.
El sobrino recibió los cargos de gentilhombre y caudatario del nuevo obispo, comenzando su carrera eclesiástica.
Realizó sus estudios en el convento de San Pablo y se doctoró en Cánones.
[1] En 1696 recibió el hábito de la Orden de Calatrava, a la que también perteneció su hermano Leonardo Salazar y Góngora y otros familiares.
Como albacea del cardenal Salazar, se encargó de finalizar varios proyectos suyos como la capilla de santa Teresa, construida como enterramiento de su tío, y el hospital del Cardenal Salazar.