Su amigo era Gerard van Swieten (1700-1772), quien había practicado la medicina y enseñado en la Universidad de Leiden, pero como católico había encontrado la vida académica de Leiden inhóspita.
También visitó las regiones costeras de Venezuela y Colombia, Haití en 1757-58; Jamaica en 1758; Cuba en 1759.
Envió siete colecciones de plantas y animales a Viena.
Fue sucedido en la Universidad de Viena por su hijo, Joseph Franz von Jacquin.
Jacquin es un botánico integral; recogía cuidadosamente el material que le serviría para el estudio taxonómico, escribía en latín la descripción morfológica y otros detalles de la planta clasificada y finalmente pintaba con acuarela la flor, el tallo, las hojas y cualquier característica especial de la planta.
En su obra Icones Plantarum Rariorum describe 97 especies del continente americano, de las cuales 47 corresponden a Venezuela.
En efecto, admite que la vio sólo desde lejos "sobre un cardón altísimo" en un toque en la costa de Coro y, por falta de tiempo y las dificultades para alcanzarla, no pudo colectarla.