Inaugurado en 2016, muestra objetos y fotografías de distintas etapas de la historia desde la inauguración del metro en 1969, así como piezas arqueológicas halladas en la construcción del mismo y obras artísticas.El proyecto estuvo a cargo de Cultura Metro; la planeación y proyección museográfica fue dirigida por Vannesa Bohórquez López; su construcción duró un año.[4] El Museo cuenta con 7 salas de las cuales 4 son permanentes y 3 temporales.La muestra, presenta las piezas arqueológicas recuperadas desde las primeras etapas de excavación del STC.El Museo ofrece visitas guiadas caracterizadas y especializadas, dirigidas a todo público interesado en conocer a profundidad la historia, así como datos curiosos sobre el Metro.
Entrada al Museo del Metro de la Ciudad de México en la estación Mixcoac.