Murió a causa de un atentado con dinamita dirigido al director del semanario, Carlos Arroyo.
Minutos antes una persona no identificada de rasgos "mestizo[s], alto y cabello lacio oscuro"[1] dejó un paquete envuelto en un periódico francés, que Alfaro llevó a la sala de redacción para leerlo.
Al abrirlo explotó una carga de dinamita que acabó con su vida.
El paquete estaba dirigido a Carlos Arroyo, jefe de Alfaro.
Se sospecha que el atentado fue parte de una serie de ataques contra políticos y activistas críticos con el gobierno y con su política para enfrentar el conflicto armado interno.