Estudió en Buenos Aires y en su juventud se dedicó a la administración de sus campos.En 1815 se negó rotundamente a pagar las contribuciones requeridas por el caudillo federal José Artigas, de modo que su estancia fue confiscada.López Jordán llamó en su ayuda a varios comandantes militares, entre ellos García de Zúñiga.En su lugar asumió el coronel Vicente Zapata, que contaba con la ayuda del joven Justo José de Urquiza.Poco después, apoyado por el presidente de la legislatura, Urquiza, rechazó la constitución unitaria del año anterior.Durante la Guerra del Brasil, el gobernador tuvo una actitud – como mínimo, ambigua – su primo Tomás García de Zúñiga era un destacado dirigente del partido favorable al Brasil en la Banda Oriental, y él mismo apoyó las actividades de la flota imperial.Inició un juicio contra Urquiza, que terminaría a su favor tras la muerte del caudillo.
