En el año 1316 su padre sucedió a Juan I como rey de Francia con el nombre de Felipe V; esta coronación llevó a que Margarita fuera comprometida con Luis I de Flandes, que se convirtió en gobernante de Flandes, Nevers y Rethel.

[1]​ El padre de Margarita murió en 1322, y su hermana mayor no pudo sucederle en virtud de la ley sálica; la reina viuda, madre de Margarita de Francia, heredó de su propia madre el territorio de Artois, y en 1330, muerta su madre, lo heredó la hermana mayor de Margarita, Juana III de Borgoña.

Pero la muerte del joven novio la convirtió a ella en la Condesa de Artois y Borgoña, y no a su nieta.

A su muerte sus posesiones pasaron a su hijo, y de su hijo lo harían finalmente a su nieta.

Fue enterrada en la Basílica de Saint-Denis por haber sido hija de un rey, su cadáver fue el último en ser profanado durante en la Revolución francesa.