La unidad se fundó en 1986, aun así su existencia no fue reconocida hasta el año 2006.
Las FDI mantienen en secreto las misiones designadas a Maglán y no hay información sobre las operaciones en las que participa la unidad.
La unidad estuvo activa en el sur del Líbano, donde llevó a cabo numerosas misiones exitosas contra el grupo chií Hezbolá.
Durante la Guerra del Líbano de 2006, la unidad participó en muchas operaciones y consiguió un gran éxito.
Se basó en entrevistas con tres oficiales al mando anónimos de la unidad Maglán.
La operación duró 11 días antes de que los soldados fueran retirados, cuando entró en vigor un alto el fuego.
[4][5] Durante la Operación Margen Protector, la unidad participó en combates en la Franja de Gaza.
Los reclutas pasan por cursos de navegación, camuflaje, observación, guerra especializada y dispositivos operativos especiales.