En la temporada 1994-1995 se unió al Valencia CF y un año más tarde fue convocado con la selección nacional sub-18.
Le operó el Dr. Pedro Guillén, empezando una amistad que se mantiene hoy día.
[cita requerida] En 1997, Luis Rubiales debutó en Segunda División B con el Guadix CF (provincia de Granada).
Pasa a jugar para Gerardo Castillo en el Granada 74, de nuevo en Tercera División.
Dejó este último club debido a los impagos de su sueldo y fichó por el Levante UD (Segunda) en la temporada 2003-04.
Se logra el ansiado ascenso a Primera División por parte del equipo Granota tras 40 años, bajo la dirección técnica de Manolo Preciado.
En la temporada 2007-2008, el Levante sufrió una grave crisis económica, que le llevó al concurso de acreedores.
Finalmente, cambió de equipo en la temporada 2008-2009 yéndose al Alicante CF (Segunda).
Allí siguieron los impagos, y sus reivindicaciones le costaron quedarse en el banquillo prácticamente toda la segunda vuelta.
En 2009 ficha por el Hamilton Academical, equipo escocés de 1.ª división del que se retira profesionalmente tras jugar solo cuatro partidos y ser elegido por la prensa local como mejor jugador del partido en dos de ellos.
Durante los 298 partidos jugados en las categorías profesionales, tanto en España como en el extranjero, marcó 1 gol.
A los pocos días de empezar sus funciones en el cargo, dejó claras sus intenciones anunciando que podría convocar una huelga y afectar a un clásico entre Real Madrid y Fútbol Club Barcelona.
Finalmente se llegó a un acuerdo por el que el 0,5% de los ingresos anuales por los derechos audiovisuales se ingresasen a la AFE para destinarlos a fines relacionados con la mejora de las condiciones laborales de los futbolistas y fomentar su inserción laboral una vez concluida su actividad como profesionales del fútbol.
Según las denuncias presentadas, su sobrino habría organizado fiestas y orgías en un chalé privado en Salobreña, Granada, en las cuales habría invitado a un grupo de ocho o diez chicas jóvenes.
[34][35] Relacionado con todo ello, la FIFA abrió expediente disciplinario a Luis Rubiales.
[42]En abril, la Audiencia Nacional española confirmó el inicio del juicio a Rubiales.
[45] Aunque Wikipedia no posee la capacidad de editar directamente sus propios artículos, al parecer, se le habría comunicado a Rubiales que esta limitación surge porque son los usuarios quienes llevan a cabo la labor de edición.
En este contexto, se le habría aconsejado al presidente que expresara sus argumentos en la sección de discusión correspondiente en el artículo en Wikipedia.