Lck entonces fosforila y activa ZAP-70, que a su vez fosforila otra molécula en la cascada de señalización llamada LAT (abreviatura de Linker of Activated T cells), una proteína transmembranal que sirve como un sitio de anclaje para varias otras proteínas, siendo las más importantes Shc-Grb2-SOS, PI3K y fosfolipasa C (PLC).
Estos incluyen la vía Ras-MEK-ERK, que se basa en activar ciertos factores de transcripción como NFAT, NFκB y AP-1.
La función de la Lck ha sido estudiada usando varios métodos bioquímicos, incluyendo la genética inversa (ratones Knockout), las células Jurkat deficientes en Lck (JCaM1.6) o la mediante RNA de interferencia.
Los dos principales sitios de fosforilación en las Lck son las tirosinas 394 y 505.
En células T en reposo, la Lck es esencialmente inhibida por la fosforilación Csk en la tirosina 505.