La Mesa es un nombre referido a las características fisiográficas del municipio, como la planicie donde se encuentra la cabecera municipal.
Por «falta de agua y abundantes lodazales» y por orden de los virreyes Pedro Messia de la Cerda, Manuel Guirior y Manuel Antonio Flórez, quienes intervinieron en distintas épocas, se trasladó en 1777 desde el sitio que ocupaba, en el cual había 98 casas y que hoy se conoce como Dos Caminos, al lugar donde se encuentra la Plaza Principal sobre la quebrada de la Carbonera, hoy canalizada.
De La Mesa partió la célebre Expedición Botánica del Virreinato de la Nueva Granada en 1783, la cual dirigió José Celestino Mutis, famoso astrónomo y botánico español que estudió la flora, la fauna y los recursos naturales del territorio.
En ella nacieron distintos héroes que terminaron sus días fusilados por las tropas españolas durante la reconquista, algunos en la misma plaza principal de la población.
Según la Enciclopedia Histórica de Cundinamarca, en las épocas española y la República, La Mesa fue la plaza comercial más importante del mencionado camino real.
Esto produce frecuentemente neblina, que los moradores llaman "la llegada Juan Díaz" (un antiguo propietario de la zona).
El municipio posee una vida nocturna en torno al sector de la Zona Rosa.
Rodeando la ciudad se encuentran espectaculares miradores donde es posible ver el cañón de la cuenca baja del río Bogotá a partir del Salto de Tequendama y el cañón del río Apulo, los cuales se unen en Juntas de Apulo para desembocar en el río Magdalena en Girardot.
También en San Javier se guarda un aparato fabricado en Inglaterra en 1928, mediante el cual y en forma manual le daban vuelta a las locomotoras del ferrocarril Girardot-Bogotá, cuando se requería darles vuelta para cambiar el sentido de la marcha, y muy cerca de ese mismo caserío se encuentra un curioso lugar en donde el fenómeno acústico del eco es particularmente destacado.
A La Mesa se puede llegar desde Bogotá saliendo por Mosquera o por Soacha por la Avenida Indumil o por Siberia pasando por Funza para tomar la ruta 21 Troncal Chia Girardot que pasa por el sur del municipio de Bojacá y Tena al occidente hasta llegar al casco urbano mesuno.