Tras la muerte de su hermano Otón III, heredó el marquesado.
Pero una vez comenzada la lucha, se vio obligado a firmar la paz por las presiones del Antipapa Clemente VII de Aviñón, que deseaba que Otón de Brunswick estuviese en su corte y no luchando por Italia.
Otón firmó el tratado de paz y aseguró las fronteras del marquesado para su ausencia.
Más tarde, Juan siguió a Otón a la corte del reino de Nápoles, pero durante su ausencia los problemas crecieron.
Cuando Carlos III fue declarado rey de Nápoles, y la reina Juana I se vio obligada a huir, Juan y Otón se encontraron inmersos en la guerra de sucesión y no pudieron regresar a Montferrato.