En 1672, Juan Ernesto dividió sus posesiones con sus hermanos menores.

Él retuvo Weimar, su hermano Juan Jorge I recibió Eisenach, y su otro hermano, Bernardo, recibió Jena.

Finalmente, los territorios divididos, Sajonia-Weimar, Sajonia-Eisenach (1741) y Sajonia-Jena (1690) fueron recombinados.

Como su padre, Juan Ernesto estuvo particularmente interesado en las artes (véase Sociedad Fructífera).

Otorgando su primordial interés a estas pesquisas, confió las riendas del gobierno a su canciller.