Poseía una remarcable biblioteca con más de 3000 volúmenes.

Debido a que sus cinco hermanastros eran todavía menores en el tiempo de su ascensión, Juan Jorge actuó como regente.

En 1603 se alcanzó un acuerdo entre Juan Jorge y sus hermanos supervivientes para dividir los territorios del principado de Anhalt entre ellos.

Juan Jorge recibió Anhalt-Dessau, así como el Seniorat; no obstante, mantuvo la regencia sobre todos los nuevos principados creados hasta 1606, cuando sus hermanos tomaron el control sobre el gobierno en sus territorios.

Fue sucedido como Príncipe de Anhalt-Dessau por su hijo mayor superviviente, Juan Casimiro.